东南大学学报（自然科学版）
東南大學學報（自然科學版）
동남대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY
2011年
4期
778-783
,共6页
吴建盛%胡栋%晏善成%马昕%谢建明%孙啸
吳建盛%鬍棟%晏善成%馬昕%謝建明%孫嘯
오건성%호동%안선성%마흔%사건명%손소
蛋白质-核酸复合物%氢键作用位点%范德华力作用位点%偏好性%氨基酸极性%协同作用
蛋白質-覈痠複閤物%氫鍵作用位點%範德華力作用位點%偏好性%氨基痠極性%協同作用
단백질-핵산복합물%경건작용위점%범덕화력작용위점%편호성%안기산겁성%협동작용
为了深入了解蛋白质-核酸相互作用模式,对复合物结构中氢键/范德华力作用力位点上的氨基酸和核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析.结果表明:氢键/范德华力作用位点上对氨基酸的偏好性差异均极其显著,与蛋白质-核酸特异作用密切相关的残基侧链与核苷酸碱基间相互作用力位点对氨基酸类型的选择特异性更高；单链RNA分子与蛋白质发生相互作用时对氨基酸残基的偏好性和双链RNA分子差异不显著；氨基酸的极性大小及方向在决定其是否与核酸分子形成范德华力作用具有重要贡献,氨基酸侧链形成的空间位阻会阻碍其与核酸分子形成氢键作用；蛋白质-DNA复合物结构氢键/范德华力作用位点上残基间空间协同作用时对氨基酸类型的选择与蛋白质-RNA复合物结构间存在显著差异.
為瞭深入瞭解蛋白質-覈痠相互作用模式,對複閤物結構中氫鍵/範德華力作用力位點上的氨基痠和覈苷痠的偏好性(即相對使用頻率)進行瞭統計分析.結果錶明:氫鍵/範德華力作用位點上對氨基痠的偏好性差異均極其顯著,與蛋白質-覈痠特異作用密切相關的殘基側鏈與覈苷痠堿基間相互作用力位點對氨基痠類型的選擇特異性更高；單鏈RNA分子與蛋白質髮生相互作用時對氨基痠殘基的偏好性和雙鏈RNA分子差異不顯著；氨基痠的極性大小及方嚮在決定其是否與覈痠分子形成範德華力作用具有重要貢獻,氨基痠側鏈形成的空間位阻會阻礙其與覈痠分子形成氫鍵作用；蛋白質-DNA複閤物結構氫鍵/範德華力作用位點上殘基間空間協同作用時對氨基痠類型的選擇與蛋白質-RNA複閤物結構間存在顯著差異.
위료심입료해단백질-핵산상호작용모식,대복합물결구중경건/범덕화력작용력위점상적안기산화핵감산적편호성(즉상대사용빈솔)진행료통계분석.결과표명:경건/범덕화력작용위점상대안기산적편호성차이균겁기현저,여단백질-핵산특이작용밀절상관적잔기측련여핵감산감기간상호작용력위점대안기산류형적선택특이성경고；단련RNA분자여단백질발생상호작용시대안기산잔기적편호성화쌍련RNA분자차이불현저；안기산적겁성대소급방향재결정기시부여핵산분자형성범덕화력작용구유중요공헌,안기산측련형성적공간위조회조애기여핵산분자형성경건작용；단백질-DNA복합물결구경건/범덕화력작용위점상잔기간공간협동작용시대안기산류형적선택여단백질-RNA복합물결구간존재현저차이.
