内蒙古农业大学学报(社会科学版)
內矇古農業大學學報(社會科學版)
내몽고농업대학학보(사회과학판)
JOURNAL OF INNER MONGOLIA AGRICULTURAL UNIVERSITY (SOCIAL SCIENCE EDITION)
2012年
5期
158-162
,共5页
于昌江%孙瑞%王忆%张新忠%韩振海
于昌江%孫瑞%王憶%張新忠%韓振海
우창강%손서%왕억%장신충%한진해
MicroRNA%小金海棠%Real-time PCR%铁胁迫
MicroRNA%小金海棠%Real-time PCR%鐵脅迫
MicroRNA%소금해당%Real-time PCR%철협박
为了研究铁高效植物小金海棠的miRNAs信息及在缺铁处理下miRNA的表达变化,以进一步了解小金海棠缺铁分子调控机制.以改良CTAB法提取的总RNA为模板,从小金海棠中分离得到miR394a.通过Real-time PCR检测miR394a的表达,并利用生物信息学方法预测了miR394a的靶基因及其功能.miR394a具有高度保守性,从小金海棠中分离的miR394a与其他物种的miR394a序列高度相似.缺铁胁迫后,小金海棠的miR394a在根及叶中都有表达,但表达模式有所不同,miR394a在根部响应较为迅速,缺铁处理1天时,即有上调表达;而在叶片的响应较晚,缺铁3天时有上调表达.miR394a的靶基因预测表明,miR394a主要调控转录因子及参与代谢途径的基因.结果表明,miR394a受缺铁胁迫所诱导,参与了小金海棠缺铁调控途径,在缺铁调控中起重要作用.
為瞭研究鐵高效植物小金海棠的miRNAs信息及在缺鐵處理下miRNA的錶達變化,以進一步瞭解小金海棠缺鐵分子調控機製.以改良CTAB法提取的總RNA為模闆,從小金海棠中分離得到miR394a.通過Real-time PCR檢測miR394a的錶達,併利用生物信息學方法預測瞭miR394a的靶基因及其功能.miR394a具有高度保守性,從小金海棠中分離的miR394a與其他物種的miR394a序列高度相似.缺鐵脅迫後,小金海棠的miR394a在根及葉中都有錶達,但錶達模式有所不同,miR394a在根部響應較為迅速,缺鐵處理1天時,即有上調錶達;而在葉片的響應較晚,缺鐵3天時有上調錶達.miR394a的靶基因預測錶明,miR394a主要調控轉錄因子及參與代謝途徑的基因.結果錶明,miR394a受缺鐵脅迫所誘導,參與瞭小金海棠缺鐵調控途徑,在缺鐵調控中起重要作用.
위료연구철고효식물소금해당적miRNAs신식급재결철처리하miRNA적표체변화,이진일보료해소금해당결철분자조공궤제.이개량CTAB법제취적총RNA위모판,종소금해당중분리득도miR394a.통과Real-time PCR검측miR394a적표체,병이용생물신식학방법예측료miR394a적파기인급기공능.miR394a구유고도보수성,종소금해당중분리적miR394a여기타물충적miR394a서렬고도상사.결철협박후,소금해당적miR394a재근급협중도유표체,단표체모식유소불동,miR394a재근부향응교위신속,결철처리1천시,즉유상조표체;이재협편적향응교만,결철3천시유상조표체.miR394a적파기인예측표명,miR394a주요조공전록인자급삼여대사도경적기인.결과표명,miR394a수결철협박소유도,삼여료소금해당결철조공도경,재결철조공중기중요작용.