重庆工学院学报(自然科学版)
重慶工學院學報(自然科學版)
중경공학원학보(자연과학판)
JOURNAL OF CHONGQING INSTITUTE OF TECHNOLOGY
2007年
4期
1-7
,共7页
林治华%王槐亮%李杰%龙海霞%万谨%王远强
林治華%王槐亮%李傑%龍海霞%萬謹%王遠彊
림치화%왕괴량%리걸%룡해하%만근%왕원강
细胞毒性T淋巴细胞(CTL)%表位%肽%CoMISA
細胞毒性T淋巴細胞(CTL)%錶位%肽%CoMISA
세포독성T림파세포(CTL)%표위%태%CoMISA
运用比较相似性指数分析(CoMISA)方法研究了203个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外30个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力.得到构效关系模型结果q2=0.548,r2=0.963,F=553.4,SD=0.154.在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型能得到明显改善.通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中30个CTL表位肽与HLA-A*0201间的亲和力(r2pred=0.532,SD=0.454).通过分析分子场等值面图在空间的分布,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽H与A-A*0201间结合亲和力的影响,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造,并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础.
運用比較相似性指數分析(CoMISA)方法研究瞭203箇HLA-A*0201限製性CTL錶位九肽結構與親和性間的關繫,另外30箇錶位九肽作為預測集用于檢驗模型的預測能力.得到構效關繫模型結果q2=0.548,r2=0.963,F=553.4,SD=0.154.在CoMSIA計算中,噹引入疏水場時,三維構效關繫模型能得到明顯改善.通過該三維構效關繫模型,可較精確地估算預測集中30箇CTL錶位肽與HLA-A*0201間的親和力(r2pred=0.532,SD=0.454).通過分析分子場等值麵圖在空間的分佈,可以觀察到錶位肽分子週圍的立體及疏水特徵對錶位肽H與A-A*0201間結閤親和力的影響,從而為進一步對CTL錶位肽進行結構改造,併基于此進行治療性疫苗分子設計提供理論基礎.
운용비교상사성지수분석(CoMISA)방법연구료203개HLA-A*0201한제성CTL표위구태결구여친화성간적관계,령외30개표위구태작위예측집용우검험모형적예측능력.득도구효관계모형결과q2=0.548,r2=0.963,F=553.4,SD=0.154.재CoMSIA계산중,당인입소수장시,삼유구효관계모형능득도명현개선.통과해삼유구효관계모형,가교정학지고산예측집중30개CTL표위태여HLA-A*0201간적친화력(r2pred=0.532,SD=0.454).통과분석분자장등치면도재공간적분포,가이관찰도표위태분자주위적입체급소수특정대표위태H여A-A*0201간결합친화력적영향,종이위진일보대CTL표위태진행결구개조,병기우차진행치료성역묘분자설계제공이론기출.