中国寄生虫学与寄生虫病杂志
中國寄生蟲學與寄生蟲病雜誌
중국기생충학여기생충병잡지
CHINESE JOURNAL OF PARASITOLOGY AND PARASITIC DISEASES
2008年
2期
104-109
,共6页
殷明波%朱根凤%张祥林%徐斌%莫筱瑾%孙胜强%王升跃%David Blair%胡薇%冯正
慇明波%硃根鳳%張祥林%徐斌%莫篠瑾%孫勝彊%王升躍%David Blair%鬍薇%馮正
은명파%주근봉%장상림%서빈%막소근%손성강%왕승약%David Blair%호미%풍정
日本血吸虫%微卫星%多态性%中国
日本血吸蟲%微衛星%多態性%中國
일본혈흡충%미위성%다태성%중국
目的 从基因组序列中选择和设定新的、可用于研究日本血吸虫多态性的微卫星位点.方法 672个日本血吸虫标本取自安徽、汀西、湖南、湖北和四川等5省的7个流行区现场.根据日本血吸虫基凼组数据库中的初始数据设计引物,对标本的17个全新的日本血吸虫微卫星位点进行分析.用GenMapper 4.0软件(Applied Biosystems)进行初始数据处理,用GenClone 1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用GenAlEx6软件统计等位基因的变化;用GenClone 1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用UPGMA谱系图分析种群间遗传距离.结果 17个微卫星位点均呈现多态性.对江西都吕种群的这17个位点进行分析,标本之间的遗传距离大多为25~32,显示江西都昌种群内各个标本之间的遗传差异明显.对7个地区种群分析的结果显示种群间的差异较为明显.类平均法系统聚类分析(UPGMA)谱系图显示,江两都昌、安徽铜陵、湖北沙市和湖南常德的种群同为一簇,其遗传距离为0.0178~0.036 3;安徽贵池和湖南岳阳的为另外一簇,其遗传距离为0.0247;而四川西昌单独为一簇,与其他两簇的遗传距离为0.0192~0.0693.结论 选择的17个微卫星位点可作为研究日本血吸虫种群遗传学的有效标记,并揭示中国大陆该虫种存在着复杂的遗传变异.
目的 從基因組序列中選擇和設定新的、可用于研究日本血吸蟲多態性的微衛星位點.方法 672箇日本血吸蟲標本取自安徽、汀西、湖南、湖北和四川等5省的7箇流行區現場.根據日本血吸蟲基凼組數據庫中的初始數據設計引物,對標本的17箇全新的日本血吸蟲微衛星位點進行分析.用GenMapper 4.0軟件(Applied Biosystems)進行初始數據處理,用GenClone 1.0軟件計算種群內各標本的遺傳距離;用GenAlEx6軟件統計等位基因的變化;用GenClone 1.0軟件計算種群內各標本的遺傳距離;用UPGMA譜繫圖分析種群間遺傳距離.結果 17箇微衛星位點均呈現多態性.對江西都呂種群的這17箇位點進行分析,標本之間的遺傳距離大多為25~32,顯示江西都昌種群內各箇標本之間的遺傳差異明顯.對7箇地區種群分析的結果顯示種群間的差異較為明顯.類平均法繫統聚類分析(UPGMA)譜繫圖顯示,江兩都昌、安徽銅陵、湖北沙市和湖南常德的種群同為一簇,其遺傳距離為0.0178~0.036 3;安徽貴池和湖南嶽暘的為另外一簇,其遺傳距離為0.0247;而四川西昌單獨為一簇,與其他兩簇的遺傳距離為0.0192~0.0693.結論 選擇的17箇微衛星位點可作為研究日本血吸蟲種群遺傳學的有效標記,併揭示中國大陸該蟲種存在著複雜的遺傳變異.
목적 종기인조서렬중선택화설정신적、가용우연구일본혈흡충다태성적미위성위점.방법 672개일본혈흡충표본취자안휘、정서、호남、호북화사천등5성적7개류행구현장.근거일본혈흡충기당조수거고중적초시수거설계인물,대표본적17개전신적일본혈흡충미위성위점진행분석.용GenMapper 4.0연건(Applied Biosystems)진행초시수거처리,용GenClone 1.0연건계산충군내각표본적유전거리;용GenAlEx6연건통계등위기인적변화;용GenClone 1.0연건계산충군내각표본적유전거리;용UPGMA보계도분석충군간유전거리.결과 17개미위성위점균정현다태성.대강서도려충군적저17개위점진행분석,표본지간적유전거리대다위25~32,현시강서도창충군내각개표본지간적유전차이명현.대7개지구충군분석적결과현시충군간적차이교위명현.류평균법계통취류분석(UPGMA)보계도현시,강량도창、안휘동릉、호북사시화호남상덕적충군동위일족,기유전거리위0.0178~0.036 3;안휘귀지화호남악양적위령외일족,기유전거리위0.0247;이사천서창단독위일족,여기타량족적유전거리위0.0192~0.0693.결론 선택적17개미위성위점가작위연구일본혈흡충충군유전학적유효표기,병게시중국대륙해충충존재착복잡적유전변이.