中国寄生虫学与寄生虫病杂志
中國寄生蟲學與寄生蟲病雜誌
중국기생충학여기생충병잡지
CHINESE JOURNAL OF PARASITOLOGY AND PARASITIC DISEASES
2008年
3期
191-196,202
,共7页
贾万忠%李志%赵亮%伦照荣
賈萬忠%李誌%趙亮%倫照榮
가만충%리지%조량%륜조영
阴道毛滴虫%半胱氨酸蛋白酶基因%变异%进化树
陰道毛滴蟲%半胱氨痠蛋白酶基因%變異%進化樹
음도모적충%반광안산단백매기인%변이%진화수
目的 研究阴道毛滴虫半胱氨酸蛋白酶(TvCP)基因变异特点,为分子种系发生和遗传进化等提供参考资料.方法 利用PCR扩增TvCP基因,用pBS-T或pET28b载体构建重组质粒,转化大肠埃希菌,筛选阳性克隆,测定目的基因序列.通过以序列相似性为基础的数据库搜索方法检索同源序列,利用Clustal X、DNAstar等软件分析TvCP基因核苷酸和氨基酸序列多态性、遗传变异和进化规律.结果克隆的TvCP2和TvCP3基因与数据库中相应参考序列在核苷酸和氨基酸水平上的相似性均为99%以上.高度保守.克隆的TvCP4基因与TvCP4参考序列在核苷酸和氨基酸水平上的相似性为97.5%以上,属于TvCP4基因家族的两个不同成员.根据阴道毛滴虫基因组数据库信息,经分析表明TvCP4酶前体由305个氨基酸残基组成,共有大小一致的TvCP4同源分子9个和N-末端缺少部分氨基酸残基的同源分子2个.它们之间的氨基酸序列相似性为62.3%～96.7%.TvCP4、TvCP1-3、TvCP12、TvCP25和半胱氨酸蛋白酶65(CP65)之间也有同源性,氨基酸序列相似性约为61%～88.2%.此外,阴道毛滴虫还拥有为数众多的其他组织蛋白酶L样成员.TvCP构成呈高度多样性.序列联配和聚类分析表明TvCP酶活性位点、酶前体结构中ERFNIN样基序和形成二硫键的半胱氨酸残基数目和位置非常保守,进化树分析也表明它们可能由共同的祖先分子通过基因复制和不断突变进化而来.结论 TvCP组成一蛋白酶家族,家族内各成员酶活性位点上残基高度保守,但其他位点上的序列呈现高度多态性;推测TvCP家族各成员可能由一个共同的祖先基因分子进化而来,在保持酶基本功能的同时又赋予多样的功能.
目的 研究陰道毛滴蟲半胱氨痠蛋白酶(TvCP)基因變異特點,為分子種繫髮生和遺傳進化等提供參攷資料.方法 利用PCR擴增TvCP基因,用pBS-T或pET28b載體構建重組質粒,轉化大腸埃希菌,篩選暘性剋隆,測定目的基因序列.通過以序列相似性為基礎的數據庫搜索方法檢索同源序列,利用Clustal X、DNAstar等軟件分析TvCP基因覈苷痠和氨基痠序列多態性、遺傳變異和進化規律.結果剋隆的TvCP2和TvCP3基因與數據庫中相應參攷序列在覈苷痠和氨基痠水平上的相似性均為99%以上.高度保守.剋隆的TvCP4基因與TvCP4參攷序列在覈苷痠和氨基痠水平上的相似性為97.5%以上,屬于TvCP4基因傢族的兩箇不同成員.根據陰道毛滴蟲基因組數據庫信息,經分析錶明TvCP4酶前體由305箇氨基痠殘基組成,共有大小一緻的TvCP4同源分子9箇和N-末耑缺少部分氨基痠殘基的同源分子2箇.它們之間的氨基痠序列相似性為62.3%～96.7%.TvCP4、TvCP1-3、TvCP12、TvCP25和半胱氨痠蛋白酶65(CP65)之間也有同源性,氨基痠序列相似性約為61%～88.2%.此外,陰道毛滴蟲還擁有為數衆多的其他組織蛋白酶L樣成員.TvCP構成呈高度多樣性.序列聯配和聚類分析錶明TvCP酶活性位點、酶前體結構中ERFNIN樣基序和形成二硫鍵的半胱氨痠殘基數目和位置非常保守,進化樹分析也錶明它們可能由共同的祖先分子通過基因複製和不斷突變進化而來.結論 TvCP組成一蛋白酶傢族,傢族內各成員酶活性位點上殘基高度保守,但其他位點上的序列呈現高度多態性;推測TvCP傢族各成員可能由一箇共同的祖先基因分子進化而來,在保持酶基本功能的同時又賦予多樣的功能.
목적 연구음도모적충반광안산단백매(TvCP)기인변이특점,위분자충계발생화유전진화등제공삼고자료.방법 이용PCR확증TvCP기인,용pBS-T혹pET28b재체구건중조질립,전화대장애희균,사선양성극륭,측정목적기인서렬.통과이서렬상사성위기출적수거고수색방법검색동원서렬,이용Clustal X、DNAstar등연건분석TvCP기인핵감산화안기산서렬다태성、유전변이화진화규률.결과극륭적TvCP2화TvCP3기인여수거고중상응삼고서렬재핵감산화안기산수평상적상사성균위99%이상.고도보수.극륭적TvCP4기인여TvCP4삼고서렬재핵감산화안기산수평상적상사성위97.5%이상,속우TvCP4기인가족적량개불동성원.근거음도모적충기인조수거고신식,경분석표명TvCP4매전체유305개안기산잔기조성,공유대소일치적TvCP4동원분자9개화N-말단결소부분안기산잔기적동원분자2개.타문지간적안기산서렬상사성위62.3%～96.7%.TvCP4、TvCP1-3、TvCP12、TvCP25화반광안산단백매65(CP65)지간야유동원성,안기산서렬상사성약위61%～88.2%.차외,음도모적충환옹유위수음다적기타조직단백매L양성원.TvCP구성정고도다양성.서렬련배화취류분석표명TvCP매활성위점、매전체결구중ERFNIN양기서화형성이류건적반광안산잔기수목화위치비상보수,진화수분석야표명타문가능유공동적조선분자통과기인복제화불단돌변진화이래.결론 TvCP조성일단백매가족,가족내각성원매활성위점상잔기고도보수,단기타위점상적서렬정현고도다태성;추측TvCP가족각성원가능유일개공동적조선기인분자진화이래,재보지매기본공능적동시우부여다양적공능.
