现代生物医学进展
現代生物醫學進展
현대생물의학진전
PROGRESS IN MODERN BIOMEDICINE
2007年
2期
175-178
,共4页
HLA-DPB1%不明确杂合子%SSP%分型
HLA-DPB1%不明確雜閤子%SSP%分型
HLA-DPB1%불명학잡합자%SSP%분형
目的:人类染色体是二倍体,这使得以测序方法研究多态性区域时会遇到不明确杂合子,这个问题在HLA-DPB1的分型上尤为突出.试图寻找一个来解决HLA-DPB1分型中不明确杂合子比例高给分型带来的困难的方案.方法:对946例样品进行HLA-DPB1分型,其中不明确杂合子有353例,共30种,占总例数的37%.建立了一套SSP分型方法,设计上游引物6条,下游引物15条,每一个样品同时用两对特异性引物进行扩增,两对引物分别代表两种不同的杂合模式.再从30种不明确杂合子类型中各挑2个样品进行克隆测序,结果与SSP分型结果比较.结果:SSP分型方法采用同一套扩增体系与两套循环反应条件,只需一次PCR扩增,就可以方便快捷地实现不明确杂合子的分辨,其结果与克隆测序结果相符.结论:与以往的克隆测序、SSCP方法相比,本研究中SSP分型方法具有高效率、高通量、省时省力的特点.
目的:人類染色體是二倍體,這使得以測序方法研究多態性區域時會遇到不明確雜閤子,這箇問題在HLA-DPB1的分型上尤為突齣.試圖尋找一箇來解決HLA-DPB1分型中不明確雜閤子比例高給分型帶來的睏難的方案.方法:對946例樣品進行HLA-DPB1分型,其中不明確雜閤子有353例,共30種,佔總例數的37%.建立瞭一套SSP分型方法,設計上遊引物6條,下遊引物15條,每一箇樣品同時用兩對特異性引物進行擴增,兩對引物分彆代錶兩種不同的雜閤模式.再從30種不明確雜閤子類型中各挑2箇樣品進行剋隆測序,結果與SSP分型結果比較.結果:SSP分型方法採用同一套擴增體繫與兩套循環反應條件,隻需一次PCR擴增,就可以方便快捷地實現不明確雜閤子的分辨,其結果與剋隆測序結果相符.結論:與以往的剋隆測序、SSCP方法相比,本研究中SSP分型方法具有高效率、高通量、省時省力的特點.
목적:인류염색체시이배체,저사득이측서방법연구다태성구역시회우도불명학잡합자,저개문제재HLA-DPB1적분형상우위돌출.시도심조일개래해결HLA-DPB1분형중불명학잡합자비례고급분형대래적곤난적방안.방법:대946례양품진행HLA-DPB1분형,기중불명학잡합자유353례,공30충,점총례수적37%.건립료일투SSP분형방법,설계상유인물6조,하유인물15조,매일개양품동시용량대특이성인물진행확증,량대인물분별대표량충불동적잡합모식.재종30충불명학잡합자류형중각도2개양품진행극륭측서,결과여SSP분형결과비교.결과:SSP분형방법채용동일투확증체계여량투순배반응조건,지수일차PCR확증,취가이방편쾌첩지실현불명학잡합자적분변,기결과여극륭측서결과상부.결론:여이왕적극륭측서、SSCP방법상비,본연구중SSP분형방법구유고효솔、고통량、성시성력적특점.
