中华实验和临床病毒学杂志
中華實驗和臨床病毒學雜誌
중화실험화림상병독학잡지
CHINESE JOURNAL OF EXPERIMENTAL AND CLINICAL VIROLOGY
2003年
4期
305-309
,共5页
姜秀丽%王健伟%温乐英%石长信%洪涛
薑秀麗%王健偉%溫樂英%石長信%洪濤
강수려%왕건위%온악영%석장신%홍도
腺病毒科%序列分析
腺病毒科%序列分析
선병독과%서렬분석
目的完成7型腺病毒疫苗株(Ad7v)的全序列测定并阐明其六邻体特征.方法克隆Ad7v基因组17.5～68.0 mu片段,应用Sanger双脱氧法进行DNA序列测定,将编码六邻体蛋白的核苷酸序列输入GenBank数据库中,获得录入号为AF515814.用CLUSTAL.V软件比较Ad7v与其他亚组及同一亚组腺病毒的六邻体蛋白的同源性,分析其抗原性的差异,同时用RasMo12.71软件预测Ad7v六邻体三维结构. 结果 Ad7v 17.5～68.0 mu由17 596个碱基组成.这段基因r链主要编码晚期基因L1、L2和L3,L链编码E2的一部分.六邻体编码多肽位于L3区,由934个氨基酸残基组成,与其他9个已知的六邻体蛋白序列进行多序列同源性比较,发现Ad7疫苗株与其他亚组腺病毒的同源性为86.8%(Ad4)～78.5%(Ad5).在同一亚组中,Ad7疫苗株与Ad3同源性最高,高达95.1%.可变序列主要集中在7个高变区( HVRs),根据Ad2六邻体三维结构模型预测Ad7六邻体三维结构,发现可变区大部分位于六邻体顶端的Ⅰ1和Ⅰ2环中.结论完成了Ad7v的全序列分析,其六邻体序列与Ad5、Ad2等其他亚组病毒有很大差异,这一结果为构建新型腺病毒载体打下了基础.
目的完成7型腺病毒疫苗株(Ad7v)的全序列測定併闡明其六鄰體特徵.方法剋隆Ad7v基因組17.5～68.0 mu片段,應用Sanger雙脫氧法進行DNA序列測定,將編碼六鄰體蛋白的覈苷痠序列輸入GenBank數據庫中,穫得錄入號為AF515814.用CLUSTAL.V軟件比較Ad7v與其他亞組及同一亞組腺病毒的六鄰體蛋白的同源性,分析其抗原性的差異,同時用RasMo12.71軟件預測Ad7v六鄰體三維結構. 結果 Ad7v 17.5～68.0 mu由17 596箇堿基組成.這段基因r鏈主要編碼晚期基因L1、L2和L3,L鏈編碼E2的一部分.六鄰體編碼多肽位于L3區,由934箇氨基痠殘基組成,與其他9箇已知的六鄰體蛋白序列進行多序列同源性比較,髮現Ad7疫苗株與其他亞組腺病毒的同源性為86.8%(Ad4)～78.5%(Ad5).在同一亞組中,Ad7疫苗株與Ad3同源性最高,高達95.1%.可變序列主要集中在7箇高變區( HVRs),根據Ad2六鄰體三維結構模型預測Ad7六鄰體三維結構,髮現可變區大部分位于六鄰體頂耑的Ⅰ1和Ⅰ2環中.結論完成瞭Ad7v的全序列分析,其六鄰體序列與Ad5、Ad2等其他亞組病毒有很大差異,這一結果為構建新型腺病毒載體打下瞭基礎.
목적완성7형선병독역묘주(Ad7v)적전서렬측정병천명기륙린체특정.방법극륭Ad7v기인조17.5～68.0 mu편단,응용Sanger쌍탈양법진행DNA서렬측정,장편마륙린체단백적핵감산서렬수입GenBank수거고중,획득록입호위AF515814.용CLUSTAL.V연건비교Ad7v여기타아조급동일아조선병독적륙린체단백적동원성,분석기항원성적차이,동시용RasMo12.71연건예측Ad7v륙린체삼유결구. 결과 Ad7v 17.5～68.0 mu유17 596개감기조성.저단기인r련주요편마만기기인L1、L2화L3,L련편마E2적일부분.륙린체편마다태위우L3구,유934개안기산잔기조성,여기타9개이지적륙린체단백서렬진행다서렬동원성비교,발현Ad7역묘주여기타아조선병독적동원성위86.8%(Ad4)～78.5%(Ad5).재동일아조중,Ad7역묘주여Ad3동원성최고,고체95.1%.가변서렬주요집중재7개고변구( HVRs),근거Ad2륙린체삼유결구모형예측Ad7륙린체삼유결구,발현가변구대부분위우륙린체정단적Ⅰ1화Ⅰ2배중.결론완성료Ad7v적전서렬분석,기륙린체서렬여Ad5、Ad2등기타아조병독유흔대차이,저일결과위구건신형선병독재체타하료기출.
