海洋科学进展
海洋科學進展
해양과학진전
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY OF HUANGHAI & BOHAI SEAS
2012年
3期
369-379
,共11页
崔志松%王绍良%臧家业%冉祥滨
崔誌鬆%王紹良%臧傢業%冉祥濱
최지송%왕소량%장가업%염상빈
溶氧低值区%生物多样性%乳山湾%变性梯度凝胶电泳
溶氧低值區%生物多樣性%乳山灣%變性梯度凝膠電泳
용양저치구%생물다양성%유산만%변성제도응효전영
采用化学裂解法从乳山湾外海溶氧低值区不同溶解氧质量浓度(3.7~7.0 mg,L-1)的6个站位海水样品中提取了环境DNA样品.以试剂盒纯化后的DNA样品为模板扩增其16S rRNA基因V3区,通过变性梯度凝胶电泳、分子文库构建及DNA测序对溶氧低值区海水中的细菌群落结构进行研究.结果表明,乳山湾外海溶氧低值区不同溶解氧质量浓度的6个站位底层海水样品中的细菌群落结构是相似的,它们均由隶属于Alteromonas(交替单胞菌属)、Salegentibacter(需盐杆菌属)等10个属的18种细菌组成.系统发育分析发现这些细菌分别属于α变形菌纲(2种)、γ变形菌纲(12种)和黄杆菌纲(3种)三个大类.在乳山湾外海溶氧低值区的海水样品中细菌多样性最高的类群是γ变形菌纲.
採用化學裂解法從乳山灣外海溶氧低值區不同溶解氧質量濃度(3.7~7.0 mg,L-1)的6箇站位海水樣品中提取瞭環境DNA樣品.以試劑盒純化後的DNA樣品為模闆擴增其16S rRNA基因V3區,通過變性梯度凝膠電泳、分子文庫構建及DNA測序對溶氧低值區海水中的細菌群落結構進行研究.結果錶明,乳山灣外海溶氧低值區不同溶解氧質量濃度的6箇站位底層海水樣品中的細菌群落結構是相似的,它們均由隸屬于Alteromonas(交替單胞菌屬)、Salegentibacter(需鹽桿菌屬)等10箇屬的18種細菌組成.繫統髮育分析髮現這些細菌分彆屬于α變形菌綱(2種)、γ變形菌綱(12種)和黃桿菌綱(3種)三箇大類.在乳山灣外海溶氧低值區的海水樣品中細菌多樣性最高的類群是γ變形菌綱.
채용화학렬해법종유산만외해용양저치구불동용해양질량농도(3.7~7.0 mg,L-1)적6개참위해수양품중제취료배경DNA양품.이시제합순화후적DNA양품위모판확증기16S rRNA기인V3구,통과변성제도응효전영、분자문고구건급DNA측서대용양저치구해수중적세균군락결구진행연구.결과표명,유산만외해용양저치구불동용해양질량농도적6개참위저층해수양품중적세균군락결구시상사적,타문균유대속우Alteromonas(교체단포균속)、Salegentibacter(수염간균속)등10개속적18충세균조성.계통발육분석발현저사세균분별속우α변형균강(2충)、γ변형균강(12충)화황간균강(3충)삼개대류.재유산만외해용양저치구적해수양품중세균다양성최고적류군시γ변형균강.