计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2012年
4期
431-435
,共5页
王四华%付晓平%王文研%张光亚
王四華%付曉平%王文研%張光亞
왕사화%부효평%왕문연%장광아
分子动力学模拟%二氢叶酸还原酶%嗜盐机理%溶剂可及性表面%氢键
分子動力學模擬%二氫葉痠還原酶%嗜鹽機理%溶劑可及性錶麵%氫鍵
분자동역학모의%이경협산환원매%기염궤리%용제가급성표면%경건
为了研究嗜盐酶如何在高盐环境下维持稳定性与活性,本文以沃尔卡尼极嗜盐菌及大肠杆菌的二氢叶酸还原酶(DHFR)为模型,将二者分别置于5种不同盐浓度的水溶液中进行分子动力学模拟.经9 ns动力学模拟,得到了二者在不同浓度盐溶液中的运动轨迹,通过对运动轨迹的分析,获取了二者在不同盐浓度下的动力学特性.结果发现嗜盐古生菌的二氢叶酸还原酶自身所形成盐桥及与溶剂所形成的氢键均比大肠杆菌的二氢叶酸还原酶多,而溶剂可及性表面则要小,二者差异均达极显著水平.同时还分析了这两种分子及其氨基酸残基的柔性等.
為瞭研究嗜鹽酶如何在高鹽環境下維持穩定性與活性,本文以沃爾卡尼極嗜鹽菌及大腸桿菌的二氫葉痠還原酶(DHFR)為模型,將二者分彆置于5種不同鹽濃度的水溶液中進行分子動力學模擬.經9 ns動力學模擬,得到瞭二者在不同濃度鹽溶液中的運動軌跡,通過對運動軌跡的分析,穫取瞭二者在不同鹽濃度下的動力學特性.結果髮現嗜鹽古生菌的二氫葉痠還原酶自身所形成鹽橋及與溶劑所形成的氫鍵均比大腸桿菌的二氫葉痠還原酶多,而溶劑可及性錶麵則要小,二者差異均達極顯著水平.同時還分析瞭這兩種分子及其氨基痠殘基的柔性等.
위료연구기염매여하재고염배경하유지은정성여활성,본문이옥이잡니겁기염균급대장간균적이경협산환원매(DHFR)위모형,장이자분별치우5충불동염농도적수용액중진행분자동역학모의.경9 ns동역학모의,득도료이자재불동농도염용액중적운동궤적,통과대운동궤적적분석,획취료이자재불동염농도하적동역학특성.결과발현기염고생균적이경협산환원매자신소형성염교급여용제소형성적경건균비대장간균적이경협산환원매다,이용제가급성표면칙요소,이자차이균체겁현저수평.동시환분석료저량충분자급기안기산잔기적유성등.
