生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2005年
10期
953-958
,共6页
酵母%基因上游%转录频率%调控位点%寡核苷酸频率分析
酵母%基因上遊%轉錄頻率%調控位點%寡覈苷痠頻率分析
효모%기인상유%전록빈솔%조공위점%과핵감산빈솔분석
前期研究表明,高效转录酵母基因内含子在序列长度、寡核苷酸使用、以及位置分布等方面都有着区别于低转录内含子的特征.进一步观察发现:上游基因间区域的序列长度与基因转录频率也有与内含子序列相同的现象,转录频率高的上游基因间序列一般部比转录频率低的长.对高效转录和低效转录上游基因间序列的寡核苷酸使用频率进行统计比较分析,抽提出高转录基因上游区可能的转录正调控元件.与酵母的所有非编码序列比较,这些可能的正调控元件基本上也是过表达的(over-represented),其中多数和实验所得的一些位点特征相吻合.这些元件富含G、C,这与内含子中可能的正调控元件在碱基组成上有一定的互补性.从这些特征看,高效转录基因上游的序列结构确实有利于基因的转录.
前期研究錶明,高效轉錄酵母基因內含子在序列長度、寡覈苷痠使用、以及位置分佈等方麵都有著區彆于低轉錄內含子的特徵.進一步觀察髮現:上遊基因間區域的序列長度與基因轉錄頻率也有與內含子序列相同的現象,轉錄頻率高的上遊基因間序列一般部比轉錄頻率低的長.對高效轉錄和低效轉錄上遊基因間序列的寡覈苷痠使用頻率進行統計比較分析,抽提齣高轉錄基因上遊區可能的轉錄正調控元件.與酵母的所有非編碼序列比較,這些可能的正調控元件基本上也是過錶達的(over-represented),其中多數和實驗所得的一些位點特徵相吻閤.這些元件富含G、C,這與內含子中可能的正調控元件在堿基組成上有一定的互補性.從這些特徵看,高效轉錄基因上遊的序列結構確實有利于基因的轉錄.
전기연구표명,고효전록효모기인내함자재서렬장도、과핵감산사용、이급위치분포등방면도유착구별우저전록내함자적특정.진일보관찰발현:상유기인간구역적서렬장도여기인전록빈솔야유여내함자서렬상동적현상,전록빈솔고적상유기인간서렬일반부비전록빈솔저적장.대고효전록화저효전록상유기인간서렬적과핵감산사용빈솔진행통계비교분석,추제출고전록기인상유구가능적전록정조공원건.여효모적소유비편마서렬비교,저사가능적정조공원건기본상야시과표체적(over-represented),기중다수화실험소득적일사위점특정상문합.저사원건부함G、C,저여내함자중가능적정조공원건재감기조성상유일정적호보성.종저사특정간,고효전록기인상유적서렬결구학실유리우기인적전록.
