医学信息
醫學信息
의학신식
MEDICAL INFORMATION
2004年
6期
308-312
,共5页
DIF14%LMBR1%分子进化
DIF14%LMBR1%分子進化
DIF14%LMBR1%분자진화
目的利用生物信息学方法分析DIF14/LMBR1蛋白的分子进化情况并分析其同源蛋白的保守区.方法利用BLAST同源比较分析寻找GenBank中与DIF14/LMBR1高度同源的蛋白序列并下载,应用Clustal X软件对蛋白序列进行多序列对齐,绘制进化树,利用SAM-T99软件分析多个序列之间的保守区.TMpred软件对下载的各种同源的蛋白序列进行跨膜区预测.结果DIF14/LMBR1蛋白在各种真核生物中存在高度保守的同源蛋白,大部分蛋白属于九次跨膜蛋白,各蛋白之间的氨基酸一致性与生物亲缘关系的远近有密切关系,人DIF14/LMBR1与lipocalin-interacting membrane receptor基因可能有相同的祖先基因,但两者功能有所不同.结论DIF14/LMBR1蛋白是真核生物中高度保守的基因,属于九次跨膜蛋白,但在细胞内具体执行的生物学功能有待进一步研究.
目的利用生物信息學方法分析DIF14/LMBR1蛋白的分子進化情況併分析其同源蛋白的保守區.方法利用BLAST同源比較分析尋找GenBank中與DIF14/LMBR1高度同源的蛋白序列併下載,應用Clustal X軟件對蛋白序列進行多序列對齊,繪製進化樹,利用SAM-T99軟件分析多箇序列之間的保守區.TMpred軟件對下載的各種同源的蛋白序列進行跨膜區預測.結果DIF14/LMBR1蛋白在各種真覈生物中存在高度保守的同源蛋白,大部分蛋白屬于九次跨膜蛋白,各蛋白之間的氨基痠一緻性與生物親緣關繫的遠近有密切關繫,人DIF14/LMBR1與lipocalin-interacting membrane receptor基因可能有相同的祖先基因,但兩者功能有所不同.結論DIF14/LMBR1蛋白是真覈生物中高度保守的基因,屬于九次跨膜蛋白,但在細胞內具體執行的生物學功能有待進一步研究.
목적이용생물신식학방법분석DIF14/LMBR1단백적분자진화정황병분석기동원단백적보수구.방법이용BLAST동원비교분석심조GenBank중여DIF14/LMBR1고도동원적단백서렬병하재,응용Clustal X연건대단백서렬진행다서렬대제,회제진화수,이용SAM-T99연건분석다개서렬지간적보수구.TMpred연건대하재적각충동원적단백서렬진행과막구예측.결과DIF14/LMBR1단백재각충진핵생물중존재고도보수적동원단백,대부분단백속우구차과막단백,각단백지간적안기산일치성여생물친연관계적원근유밀절관계,인DIF14/LMBR1여lipocalin-interacting membrane receptor기인가능유상동적조선기인,단량자공능유소불동.결론DIF14/LMBR1단백시진핵생물중고도보수적기인,속우구차과막단백,단재세포내구체집행적생물학공능유대진일보연구.
