微生物学通报
微生物學通報
미생물학통보
MICROBIOLOGY
2002年
4期
22-28
,共7页
赵贵军%何智良%卢阳%叶兰汀%徐安龙
趙貴軍%何智良%盧暘%葉蘭汀%徐安龍
조귀군%하지량%로양%협란정%서안룡
生物信息学%细菌基因组%功能注释
生物信息學%細菌基因組%功能註釋
생물신식학%세균기인조%공능주석
随着人类基因组计划及其它测序工作顺利进行,人们已经得到了大量的基因序列.如何阐明这些序列的功能和意义,是功能基因组学的主要任务.生物信息学和比较基因组学为加速这一进程提供了有利的工具.该研究建立了对已经完成全基因组测序和部分测序的25种细菌的基因组的生物信息学研究平台,提供了WEB形式的服务(http:∥202.116.74.108).25种细菌的全基因组蛋白质序列可以在NCBI的ftp:∥ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/bacteria下载.该系统可以按照基因序列号、功能和种属名查询基因序列,根据美国国家信息中心(NCBI)的功能代码表对每个基因进行了自动和手工分类,并可查询分类情况,在此基础上建立了几种亲缘关系相近的种属的同源基因相互注释功能的应用.
隨著人類基因組計劃及其它測序工作順利進行,人們已經得到瞭大量的基因序列.如何闡明這些序列的功能和意義,是功能基因組學的主要任務.生物信息學和比較基因組學為加速這一進程提供瞭有利的工具.該研究建立瞭對已經完成全基因組測序和部分測序的25種細菌的基因組的生物信息學研究平檯,提供瞭WEB形式的服務(http:∥202.116.74.108).25種細菌的全基因組蛋白質序列可以在NCBI的ftp:∥ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/bacteria下載.該繫統可以按照基因序列號、功能和種屬名查詢基因序列,根據美國國傢信息中心(NCBI)的功能代碼錶對每箇基因進行瞭自動和手工分類,併可查詢分類情況,在此基礎上建立瞭幾種親緣關繫相近的種屬的同源基因相互註釋功能的應用.
수착인류기인조계화급기타측서공작순리진행,인문이경득도료대량적기인서렬.여하천명저사서렬적공능화의의,시공능기인조학적주요임무.생물신식학화비교기인조학위가속저일진정제공료유리적공구.해연구건립료대이경완성전기인조측서화부분측서적25충세균적기인조적생물신식학연구평태,제공료WEB형식적복무(http:∥202.116.74.108).25충세균적전기인조단백질서렬가이재NCBI적ftp:∥ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/bacteria하재.해계통가이안조기인서렬호、공능화충속명사순기인서렬,근거미국국가신식중심(NCBI)적공능대마표대매개기인진행료자동화수공분류,병가사순분류정황,재차기출상건립료궤충친연관계상근적충속적동원기인상호주석공능적응용.
