水生生物学报
水生生物學報
수생생물학보
ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA
2011年
4期
681-687
,共7页
李偲%刘航%黄容%李华英%石米娟%廖兰杰%朱作言%汪亚平
李偲%劉航%黃容%李華英%石米娟%廖蘭傑%硃作言%汪亞平
리시%류항%황용%리화영%석미연%료란걸%주작언%왕아평
草鱼%微卫星标记%多态信息含量
草魚%微衛星標記%多態信息含量
초어%미위성표기%다태신식함량
表达序列标签(EST)是发掘Ⅰ型微卫星标记的重要资源.研究运用生物信息学方法,从草鱼头肾组织3027条EST序列中搜索到322个微卫星位点,占整个EST数据库的10.6％.其中,二核苷酸重复位点151个(46.9％),三核苷酸重复位点137个(42.5％),四、五、六核苷酸重复位点较少；在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的50.3％,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的40.4％,AT和GC重复较少.10个微卫星位点的多态性检测结果显示,4个位点在草鱼测试群体中呈多态性,多态性位点的平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.5236和0.5441,其中,2个多态性位点的PIC值大于0.5,呈现高度多态性特征.Ⅰ型微卫星标记将为草鱼遗传连锁图谱构建和QTL分析提供有效的基因分子标记.
錶達序列標籤(EST)是髮掘Ⅰ型微衛星標記的重要資源.研究運用生物信息學方法,從草魚頭腎組織3027條EST序列中搜索到322箇微衛星位點,佔整箇EST數據庫的10.6％.其中,二覈苷痠重複位點151箇(46.9％),三覈苷痠重複位點137箇(42.5％),四、五、六覈苷痠重複位點較少；在二覈苷痠重複位點中,AC/GT重複位點最為豐富,佔二覈苷痠重複位點總數的50.3％,AG/CT重複次之,佔二覈苷痠重複位點總數的40.4％,AT和GC重複較少.10箇微衛星位點的多態性檢測結果顯示,4箇位點在草魚測試群體中呈多態性,多態性位點的平均多態信息含量(PIC)和平均遺傳雜閤度(H)分彆為0.5236和0.5441,其中,2箇多態性位點的PIC值大于0.5,呈現高度多態性特徵.Ⅰ型微衛星標記將為草魚遺傳連鎖圖譜構建和QTL分析提供有效的基因分子標記.
표체서렬표첨(EST)시발굴Ⅰ형미위성표기적중요자원.연구운용생물신식학방법,종초어두신조직3027조EST서렬중수색도322개미위성위점,점정개EST수거고적10.6％.기중,이핵감산중복위점151개(46.9％),삼핵감산중복위점137개(42.5％),사、오、륙핵감산중복위점교소；재이핵감산중복위점중,AC/GT중복위점최위봉부,점이핵감산중복위점총수적50.3％,AG/CT중복차지,점이핵감산중복위점총수적40.4％,AT화GC중복교소.10개미위성위점적다태성검측결과현시,4개위점재초어측시군체중정다태성,다태성위점적평균다태신식함량(PIC)화평균유전잡합도(H)분별위0.5236화0.5441,기중,2개다태성위점적PIC치대우0.5,정현고도다태성특정.Ⅰ형미위성표기장위초어유전련쇄도보구건화QTL분석제공유효적기인분자표기.
