微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2006年
6期
895-899
,共5页
王侃%刘次全%曹槐%陈雪峰
王侃%劉次全%曹槐%陳雪峰
왕간%류차전%조괴%진설봉
大肠杆菌%密码子偏好性%mRNA编码区%mRNA二级结构%翻译效率
大腸桿菌%密碼子偏好性%mRNA編碼區%mRNA二級結構%翻譯效率
대장간균%밀마자편호성%mRNA편마구%mRNA이급결구%번역효솔
从GenBank获得大肠杆菌K-12 MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱.另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析.
從GenBank穫得大腸桿菌K-12 MG1655株的全基因組序列,計算瞭與基因密碼子偏好性相關的多箇參數(Nc、CAI、GC、GC3s),對其mRNA編碼區長度、形成二級結構傾嚮與密碼子偏好性之間的關繫進行瞭統計學分析,髮現雖然翻譯效率(包括翻譯速度和翻譯精度)是製約大腸桿菌高錶達基因的密碼子偏好性的主要因素,同時,mRNA編碼區長度及其形成二級結構的傾嚮也是形成這種偏好性的不可忽略的原因,而且對偏好性有一定程度的削弱.另外對mRNA編碼區形成二級結構傾嚮的生物學意義進行瞭討論分析.
종GenBank획득대장간균K-12 MG1655주적전기인조서렬,계산료여기인밀마자편호성상관적다개삼수(Nc、CAI、GC、GC3s),대기mRNA편마구장도、형성이급결구경향여밀마자편호성지간적관계진행료통계학분석,발현수연번역효솔(포괄번역속도화번역정도)시제약대장간균고표체기인적밀마자편호성적주요인소,동시,mRNA편마구장도급기형성이급결구적경향야시형성저충편호성적불가홀략적원인,이차대편호성유일정정도적삭약.령외대mRNA편마구형성이급결구경향적생물학의의진행료토론분석.
