科学通报
科學通報
과학통보
CHINESE SCIENCE BULLETIN
2007年
15期
1779-1787
,共9页
张艳欣%林忠旭%李武%涂礼莉%聂以春%张献龙
張豔訢%林忠旭%李武%塗禮莉%聶以春%張獻龍
장염흔%림충욱%리무%도례리%섭이춘%장헌룡
海岛棉%表达序列标签(EST)%简单序列重复(SSR)%遗传多样性%遗传连锁图
海島棉%錶達序列標籤(EST)%簡單序列重複(SSR)%遺傳多樣性%遺傳連鎖圖
해도면%표체서렬표첨(EST)%간단서렬중복(SSR)%유전다양성%유전련쇄도
现有的棉花EST-SSR引物大都开发于中棉和陆地棉, 尚没有海岛棉EST-SSR开发研究的报道. 本研究从实验室构建的海岛棉纤维发育的cDNA文库中先取98条EST序列设计了119对EST-SSR引物. 在这些SSR中, 三核苷酸重复基序AAG含量最为丰富, 达11.76%. 用36份材料(13份A基因组二倍体材料, 11份D基因组二倍体材料和12份AD基因组异源四倍体材料)评价新EST-SSR引物, 119对引物中有76对成功扩增, 共产生313条多态性条带, 平均每对引物产生4.11条. 这些引物的多态性信息含量(PIC)变化在0.17～0.95之间, 平均0.53. 根据Jaccard's遗传相似系数对所用36份材料进行了聚类分析, 聚类结果为3大类, 分别为A基因组材料、D基因组材料和AD基因组材料. 此外, 有21对引物在本实验室的种间回交群体((鄂棉22 × Pima3-79) ×鄂棉22) DNA中表现多态性扩增, 产生24个多态性位点, 其中22个被锚定于该遗传连锁图的12条染色体. 本研究不仅详细地概括了这批新的EST-SSR引物的特征, 而且有力地证明了其在遗传多样性分析及遗传连锁图构建方面的应用价值.
現有的棉花EST-SSR引物大都開髮于中棉和陸地棉, 尚沒有海島棉EST-SSR開髮研究的報道. 本研究從實驗室構建的海島棉纖維髮育的cDNA文庫中先取98條EST序列設計瞭119對EST-SSR引物. 在這些SSR中, 三覈苷痠重複基序AAG含量最為豐富, 達11.76%. 用36份材料(13份A基因組二倍體材料, 11份D基因組二倍體材料和12份AD基因組異源四倍體材料)評價新EST-SSR引物, 119對引物中有76對成功擴增, 共產生313條多態性條帶, 平均每對引物產生4.11條. 這些引物的多態性信息含量(PIC)變化在0.17～0.95之間, 平均0.53. 根據Jaccard's遺傳相似繫數對所用36份材料進行瞭聚類分析, 聚類結果為3大類, 分彆為A基因組材料、D基因組材料和AD基因組材料. 此外, 有21對引物在本實驗室的種間迴交群體((鄂棉22 × Pima3-79) ×鄂棉22) DNA中錶現多態性擴增, 產生24箇多態性位點, 其中22箇被錨定于該遺傳連鎖圖的12條染色體. 本研究不僅詳細地概括瞭這批新的EST-SSR引物的特徵, 而且有力地證明瞭其在遺傳多樣性分析及遺傳連鎖圖構建方麵的應用價值.
현유적면화EST-SSR인물대도개발우중면화륙지면, 상몰유해도면EST-SSR개발연구적보도. 본연구종실험실구건적해도면섬유발육적cDNA문고중선취98조EST서렬설계료119대EST-SSR인물. 재저사SSR중, 삼핵감산중복기서AAG함량최위봉부, 체11.76%. 용36빈재료(13빈A기인조이배체재료, 11빈D기인조이배체재료화12빈AD기인조이원사배체재료)평개신EST-SSR인물, 119대인물중유76대성공확증, 공산생313조다태성조대, 평균매대인물산생4.11조. 저사인물적다태성신식함량(PIC)변화재0.17～0.95지간, 평균0.53. 근거Jaccard's유전상사계수대소용36빈재료진행료취류분석, 취류결과위3대류, 분별위A기인조재료、D기인조재료화AD기인조재료. 차외, 유21대인물재본실험실적충간회교군체((악면22 × Pima3-79) ×악면22) DNA중표현다태성확증, 산생24개다태성위점, 기중22개피묘정우해유전련쇄도적12조염색체. 본연구불부상세지개괄료저비신적EST-SSR인물적특정, 이차유력지증명료기재유전다양성분석급유전련쇄도구건방면적응용개치.
