化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2004年
2期
148-152
,共5页
潘咏梅%侯廷军%计明娟%徐筱杰%叶学其
潘詠梅%侯廷軍%計明娟%徐篠傑%葉學其
반영매%후정군%계명연%서소걸%협학기
PTP1B,1,2-萘醌类抑制剂,动力学模拟
PTP1B,1,2-萘醌類抑製劑,動力學模擬
PTP1B,1,2-내곤류억제제,동역학모의
采用分子动力学和分子力学相结合的方法,研究了一类1,2-萘醌类抑制剂与酪氨酸蛋白磷酸酯酶PTP1B之间的相互作用模式.计算得到的抑制剂和靶酶之间的相互作用模式显示范德华相互作用、疏水相互作用以及氢键作用是主要的作用模式.计算结果还表明抑制剂和PTP1B的相互作用能ΔE越低,抑制剂活性越高.通过计算各种能量对ΔE的贡献,以及对复合物结构参数的分析,发现抑制剂和受体之间疏水相互作用是造成抑制剂活性差别的主要原因.这为设计其他非酸类抑制剂提供了信息.
採用分子動力學和分子力學相結閤的方法,研究瞭一類1,2-萘醌類抑製劑與酪氨痠蛋白燐痠酯酶PTP1B之間的相互作用模式.計算得到的抑製劑和靶酶之間的相互作用模式顯示範德華相互作用、疏水相互作用以及氫鍵作用是主要的作用模式.計算結果還錶明抑製劑和PTP1B的相互作用能ΔE越低,抑製劑活性越高.通過計算各種能量對ΔE的貢獻,以及對複閤物結構參數的分析,髮現抑製劑和受體之間疏水相互作用是造成抑製劑活性差彆的主要原因.這為設計其他非痠類抑製劑提供瞭信息.
채용분자동역학화분자역학상결합적방법,연구료일류1,2-내곤류억제제여락안산단백린산지매PTP1B지간적상호작용모식.계산득도적억제제화파매지간적상호작용모식현시범덕화상호작용、소수상호작용이급경건작용시주요적작용모식.계산결과환표명억제제화PTP1B적상호작용능ΔE월저,억제제활성월고.통과계산각충능량대ΔE적공헌,이급대복합물결구삼수적분석,발현억제제화수체지간소수상호작용시조성억제제활성차별적주요원인.저위설계기타비산류억제제제공료신식.
