微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2007年
6期
951-955
,共5页
拟诺卡氏菌属%系统发育分析%16S rRNA基因%看家基因
擬諾卡氏菌屬%繫統髮育分析%16S rRNA基因%看傢基因
의낙잡씨균속%계통발육분석%16S rRNA기인%간가기인
为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建.研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度.比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致.因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性.
為瞭更好地瞭解擬諾卡氏菌屬(Nocardiopsis)各物種間的繫統髮育關繫,該屬現有有效描述種的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被測定,結閤16S rRNA基因,對擬諾卡氏菌屬進行瞭繫統髮育重建.研究髮現擬諾卡氏菌屬gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分彆為87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性則達到96.65%,3箇看傢基因均比16S rRNA具有更高的分歧度.比較基于不同基因的繫統樹髮現,由gyrB基因得到的繫統樹拓撲結構與16S rRNA得到的結構在亞群上基本一緻.因此,gyrB基因在擬諾卡氏菌屬的繫統分類上比16S rRNA基因更具優越性.
위료경호지료해의낙잡씨균속(Nocardiopsis)각물충간적계통발육관계,해속현유유효묘술충적gyrB,sod화rpoB기인적부분서렬피측정,결합16S rRNA기인,대의낙잡씨균속진행료계통발육중건.연구발현의낙잡씨균속gyrB,sod화rpoB기인적평균상사성분별위87.7%、87.3%화94.1%,이16S rRNA기인적평균상사성칙체도96.65%,3개간가기인균비16S rRNA구유경고적분기도.비교기우불동기인적계통수발현,유gyrB기인득도적계통수탁복결구여16S rRNA득도적결구재아군상기본일치.인차,gyrB기인재의낙잡씨균속적계통분류상비16S rRNA기인경구우월성.
