生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2008年
1期
6-8
,共3页
条斑紫菜%6-磷酸海藻糖合成酶%电子克隆
條斑紫菜%6-燐痠海藻糖閤成酶%電子剋隆
조반자채%6-린산해조당합성매%전자극륭
利用日本DDBJ数据库电子克隆了条斑紫菜的6-磷酸海藻糖合成酶基因(pytps),得到全长cDNA序列2727bp;经过ORFfinder分析,获得了相应蛋白质的全长序列908An,分子量约为101.8kD.将条斑紫菜的6-磷酸海藻糖合成酶与多种模式生物大肠杆茼、裂殖酵母、拟南芥、水稻、秀丽隐杆线虫、黑腹果蝇的同源蛋白进行序列比对得到了聚类分析图表明它们之间具有一定的进化相关性功能结构域预测分析显示PyTPS拥有两个功能结构域Clyco.transf 20 domain和Trehalose.PPase domain,这对于进一步分析蛋白质结构与功能的关系将有很大的启示.
利用日本DDBJ數據庫電子剋隆瞭條斑紫菜的6-燐痠海藻糖閤成酶基因(pytps),得到全長cDNA序列2727bp;經過ORFfinder分析,穫得瞭相應蛋白質的全長序列908An,分子量約為101.8kD.將條斑紫菜的6-燐痠海藻糖閤成酶與多種模式生物大腸桿茼、裂殖酵母、擬南芥、水稻、秀麗隱桿線蟲、黑腹果蠅的同源蛋白進行序列比對得到瞭聚類分析圖錶明它們之間具有一定的進化相關性功能結構域預測分析顯示PyTPS擁有兩箇功能結構域Clyco.transf 20 domain和Trehalose.PPase domain,這對于進一步分析蛋白質結構與功能的關繫將有很大的啟示.
이용일본DDBJ수거고전자극륭료조반자채적6-린산해조당합성매기인(pytps),득도전장cDNA서렬2727bp;경과ORFfinder분석,획득료상응단백질적전장서렬908An,분자량약위101.8kD.장조반자채적6-린산해조당합성매여다충모식생물대장간동、렬식효모、의남개、수도、수려은간선충、흑복과승적동원단백진행서렬비대득도료취류분석도표명타문지간구유일정적진화상관성공능결구역예측분석현시PyTPS옹유량개공능결구역Clyco.transf 20 domain화Trehalose.PPase domain,저대우진일보분석단백질결구여공능적관계장유흔대적계시.
