新基因6次跨膜表位抗原4在肥胖患儿脂肪组织的表达及生物信息学分析
신기인6차과막표위항원4재비반환인지방조직적표체급생물신식학분석
A novel gene six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4: Expression in the adipose tissue of obese children and bioinformatic analysis
  • 万方数据
    医学研究生学报 의학연구생학보
    JOURNAL OF MEDICAL POSTGRADUATE
    2011年 2期 117-121 ,共5页

    高春林%刘光陵%夏正坤%邱洁%高远赋%樊忠民%伏洁%任献国%徐敏%郭锡熔

    고춘림%류광릉%하정곤%구길%고원부%번충민%복길%임헌국%서민%곽석용

    肥胖症%STEAP%基因表达%计算生物学 肥胖癥%STEAP%基因錶達%計算生物學
    비반증%STEAP%기인표체%계산생물학
    目的 肥胖呈现全球流行趋势.目前,已基本证实其为一种多基因遗传病,先前研究小组筛选获得肥胖相关的新基因6次跨膜表位抗原(six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4,STEAP4)在肥胖患儿脂肪组织中差异表达,旨在进一步验证其在肥胖儿童脂肪组织中的表达,并初步探讨STEAP4的生物信息学特征.方法 采用实时荧光定量PCR(Realtime-qPCR)技术验证肥胖与健康儿童脂肪组织中STEAP4基因的表达差异,应用DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、Interpro Scan 和SMART等软件或数据库分析STEAP4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、结构域及亚细胞定位等.结果 STEAP4基因是一个功能未知的基因,低表达于肥胖患儿脂肪组织中,生物信息学分析该基因cDNA全长4454bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)长1380bp,编码459个氨基酸,预测相对分子质量51981.2,定位在胞膜,蛋白序列分析显示为6次跨膜螺旋结构,为可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析显示具有黄素蛋白跨膜成分(三铁还原酶结构域),NAD(P)结合结构域,NADP氧化还原酶(依赖辅酶F420)和血红素蛋白保守位点.结论 STEAP4基因是一低表达于肥胖患儿脂肪组织中的基因,高度提示该蛋白与肥胖及其相关的胰岛素抵抗的发生存在相关性,值得进一步研究证实.
    목적 비반정현전구류행추세.목전,이기본증실기위일충다기인유전병,선전연구소조사선획득비반상관적신기인6차과막표위항원(six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4,STEAP4)재비반환인지방조직중차이표체,지재진일보험증기재비반인동지방조직중적표체,병초보탐토STEAP4적생물신식학특정.방법 채용실시형광정량PCR(Realtime-qPCR)기술험증비반여건강인동지방조직중STEAP4기인적표체차이,응용DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、Interpro Scan 화SMART등연건혹수거고분석STEAP4적핵감산기본특정、단백질이화성질、신호태、과막결구역、소수성/친수성、결구역급아세포정위등.결과 STEAP4기인시일개공능미지적기인,저표체우비반환인지방조직중,생물신식학분석해기인cDNA전장4454bp,개방열독광(open reading frame,ORF)장1380bp,편마459개안기산,예측상대분자질량51981.2,정위재포막,단백서렬분석현시위6차과막라선결구,위가용적친수성단백,단백결구역분석현시구유황소단백과막성분(삼철환원매결구역),NAD(P)결합결구역,NADP양화환원매(의뢰보매F420)화혈홍소단백보수위점.결론 STEAP4기인시일저표체우비반환인지방조직중적기인,고도제시해단백여비반급기상관적이도소저항적발생존재상관성,치득진일보연구증실.
    원문보기 원문다운로드 사이트로이동
저자의 최근 논문