江西农业大学学报
江西農業大學學報
강서농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS
2011年
1期
128-136
,共9页
吴异健%王劭%黄一帆%吴宝成
吳異健%王劭%黃一帆%吳寶成
오이건%왕소%황일범%오보성
番鸭呼肠孤病毒%σNS基因%克隆%序列分析
番鴨呼腸孤病毒%σNS基因%剋隆%序列分析
번압호장고병독%σNS기인%극륭%서렬분석
参考GenBank鸡正呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)和番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirns,DRV)σ非结构蛋白(σNS)基因序列设计合成1对引物,对番鸭呼肠孤病毒YB(DRV-YB)株σNS基因进行RT-PCR扩增,克隆到pMD18-T载体中,并对克隆产物进行PCR鉴定和测序; DRV-YB株编码σNS的基因全长为1 191 bp,其5' 和3' 端具有典型的禽正呼肠孤病毒的特征,开放阅读框从24~1 127位碱基,编码367个氨基酸残基.DRV-YB株与法国番鸭呼肠孤病毒89026(DRV-89026)株和鸡呼肠孤病毒S1133(ARV-S1133)株σNS基因核苷酸同源性分别为87.3%和76.5%;推导氨基酸同源性分别为94.8%和 90.5%.进化树分析表明DRV-YB株σNS与DRV-89026株亲缘关系较近,处在番鸭呼肠孤病毒的分支上.分析发现DRV-YB株S组基因大小和编码蛋白与法国番鸭呼肠孤病毒89026、89330株S组一致,具有法国番鸭呼肠孤病毒89026、89330株S组的特征,而与ARVS1133、176等鸡源呼肠孤病毒差异较大.表明不同禽正呼肠孤病毒株S组基因的大小和编码同一蛋白的等位基因呈现多态性,自然界中禽正呼肠孤病毒不同毒株之间存在基因交换和基因重组现象.
參攷GenBank鷄正呼腸孤病毒(Avian reovirus,ARV)和番鴨呼腸孤病毒(Muscovy duck reovirns,DRV)σ非結構蛋白(σNS)基因序列設計閤成1對引物,對番鴨呼腸孤病毒YB(DRV-YB)株σNS基因進行RT-PCR擴增,剋隆到pMD18-T載體中,併對剋隆產物進行PCR鑒定和測序; DRV-YB株編碼σNS的基因全長為1 191 bp,其5' 和3' 耑具有典型的禽正呼腸孤病毒的特徵,開放閱讀框從24~1 127位堿基,編碼367箇氨基痠殘基.DRV-YB株與法國番鴨呼腸孤病毒89026(DRV-89026)株和鷄呼腸孤病毒S1133(ARV-S1133)株σNS基因覈苷痠同源性分彆為87.3%和76.5%;推導氨基痠同源性分彆為94.8%和 90.5%.進化樹分析錶明DRV-YB株σNS與DRV-89026株親緣關繫較近,處在番鴨呼腸孤病毒的分支上.分析髮現DRV-YB株S組基因大小和編碼蛋白與法國番鴨呼腸孤病毒89026、89330株S組一緻,具有法國番鴨呼腸孤病毒89026、89330株S組的特徵,而與ARVS1133、176等鷄源呼腸孤病毒差異較大.錶明不同禽正呼腸孤病毒株S組基因的大小和編碼同一蛋白的等位基因呈現多態性,自然界中禽正呼腸孤病毒不同毒株之間存在基因交換和基因重組現象.
삼고GenBank계정호장고병독(Avian reovirus,ARV)화번압호장고병독(Muscovy duck reovirns,DRV)σ비결구단백(σNS)기인서렬설계합성1대인물,대번압호장고병독YB(DRV-YB)주σNS기인진행RT-PCR확증,극륭도pMD18-T재체중,병대극륭산물진행PCR감정화측서; DRV-YB주편마σNS적기인전장위1 191 bp,기5' 화3' 단구유전형적금정호장고병독적특정,개방열독광종24~1 127위감기,편마367개안기산잔기.DRV-YB주여법국번압호장고병독89026(DRV-89026)주화계호장고병독S1133(ARV-S1133)주σNS기인핵감산동원성분별위87.3%화76.5%;추도안기산동원성분별위94.8%화 90.5%.진화수분석표명DRV-YB주σNS여DRV-89026주친연관계교근,처재번압호장고병독적분지상.분석발현DRV-YB주S조기인대소화편마단백여법국번압호장고병독89026、89330주S조일치,구유법국번압호장고병독89026、89330주S조적특정,이여ARVS1133、176등계원호장고병독차이교대.표명불동금정호장고병독주S조기인적대소화편마동일단백적등위기인정현다태성,자연계중금정호장고병독불동독주지간존재기인교환화기인중조현상.