CAJ | 학술논문

基因调控网络的重构是功能基因组中最具挑战性的课题之一. 针对基因间转录调控的时间延迟性, 提出了一种寻找时间延迟调控关系的方法: 多点延迟调控网络算法, 简称TdGRN (time-delayed gene regulatory networking). 该方法根据时间序列基因表达谱数据, 构建时间延迟基因表达矩阵, 利用有监督决策树分类器方法和随机重排技术挖掘基因之间的时间延迟调控关系, 从而构建时间延迟的基因调控网络. 该方法是一种不依赖模型的基因网络重建方法, 相对于目前采用的基于模型的网络重建方法有显著优势, 可直接利用连续的基因表达谱数据发现延迟任一时间单位差的基因表达调控关系, 并避免了目前一些研究方法中需要人为设定基因的最大调控子数目()的问题. 将该方法应用于酿酒酵母细胞周期的基因表达谱数据, 并构建时间延迟的基因调控网络, 结果发现多数时间延迟调控关系获得了已有知识的支持.
기인조공망락적중구시공능기인조중최구도전성적과제지일. 침대기인간전록조공적시간연지성, 제출료일충심조시간연지조공관계적방법: 다점연지조공망락산법, 간칭TdGRN (time-delayed gene regulatory networking). 해방법근거시간서렬기인표체보수거, 구건시간연지기인표체구진, 이용유감독결책수분류기방법화수궤중배기술알굴기인지간적시간연지조공관계, 종이구건시간연지적기인조공망락. 해방법시일충불의뢰모형적기인망락중건방법, 상대우목전채용적기우모형적망락중건방법유현저우세, 가직접이용련속적기인표체보수거발현연지임일시간단위차적기인표체조공관계, 병피면료목전일사연구방법중수요인위설정기인적최대조공자수목()적문제. 장해방법응용우양주효모세포주기적기인표체보수거, 병구건시간연지적기인조공망락, 결과발현다수시간연지조공관계획득료이유지식적지지.