微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2008年
4期
432-438
,共7页
陈兰%张小平%Kristina Lindstrom
陳蘭%張小平%Kristina Lindstrom
진란%장소평%Kristina Lindstrom
芽孢杆菌%多样性%数值分类%16S DNA PCR-RFLP%BOX-PCR指纹图谱%系统发育
芽孢桿菌%多樣性%數值分類%16S DNA PCR-RFLP%BOX-PCR指紋圖譜%繫統髮育
아포간균%다양성%수치분류%16S DNA PCR-RFLP%BOX-PCR지문도보%계통발육
[目的]了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性.[方法]采用数值分类、16S rDNA PCR RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究.[结果]供试菌株在数值分类聚类分析中在84%的相似水平上产生13个表观群.16S rDNAPCR-RFLP分析表明供试菌株表现出丰富的遗传多样性.BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明药用植物的内生芽孢杆菌的基因组也具有多样性,聚群的结果与数值分类有较好一致性.用软件在Genbank中进行所得序列的同源性检索,并构建系统发育树.由16S rDNA序列分析可知,供试的代表菌株SCAU11与球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)亲缘关系最近,SCAU78和SCAU25为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的两个亚种,代表菌株SCAU39与巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)的亲缘关系最近.[结论]研究结果表明药用植物内生芽孢杆菌具有明显的表型和遗传多样性.
[目的]瞭解藥用植物內生芽孢桿菌的生物多樣性.[方法]採用數值分類、16S rDNA PCR RFLP、BOX-PCR指紋圖譜和16S rDNA序列分析技術對分離于幾種藥用植物的內生芽孢桿菌和已知參比菌株進行錶型、遺傳多樣性及繫統髮育研究.[結果]供試菌株在數值分類聚類分析中在84%的相似水平上產生13箇錶觀群.16S rDNAPCR-RFLP分析錶明供試菌株錶現齣豐富的遺傳多樣性.BOX-PCR指紋圖譜分析進一步證明藥用植物的內生芽孢桿菌的基因組也具有多樣性,聚群的結果與數值分類有較好一緻性.用軟件在Genbank中進行所得序列的同源性檢索,併構建繫統髮育樹.由16S rDNA序列分析可知,供試的代錶菌株SCAU11與毬形芽孢桿菌(Bacillus sphaericus)親緣關繫最近,SCAU78和SCAU25為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的兩箇亞種,代錶菌株SCAU39與巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium)的親緣關繫最近.[結論]研究結果錶明藥用植物內生芽孢桿菌具有明顯的錶型和遺傳多樣性.
[목적]료해약용식물내생아포간균적생물다양성.[방법]채용수치분류、16S rDNA PCR RFLP、BOX-PCR지문도보화16S rDNA서렬분석기술대분리우궤충약용식물적내생아포간균화이지삼비균주진행표형、유전다양성급계통발육연구.[결과]공시균주재수치분류취류분석중재84%적상사수평상산생13개표관군.16S rDNAPCR-RFLP분석표명공시균주표현출봉부적유전다양성.BOX-PCR지문도보분석진일보증명약용식물적내생아포간균적기인조야구유다양성,취군적결과여수치분류유교호일치성.용연건재Genbank중진행소득서렬적동원성검색,병구건계통발육수.유16S rDNA서렬분석가지,공시적대표균주SCAU11여구형아포간균(Bacillus sphaericus)친연관계최근,SCAU78화SCAU25위고초아포간균(Bacillus subtilis)적량개아충,대표균주SCAU39여거대아포간균(Bacillus megaterium)적친연관계최근.[결론]연구결과표명약용식물내생아포간균구유명현적표형화유전다양성.
