生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
4期
350-355
,共6页
焦清局%刘太岗%郑小琪%连爱娥%黄继风
焦清跼%劉太崗%鄭小琪%連愛娥%黃繼風
초청국%류태강%정소기%련애아%황계풍
拟南芥%花药%共表达%最大团%ATTED-II数据库
擬南芥%花藥%共錶達%最大糰%ATTED-II數據庫
의남개%화약%공표체%최대단%ATTED-II수거고
运用图论中最大团算法,对ATTED-II数据库中提供的拟南芥共表达数据进行分析,为进一步研究基因功能提供了较为可靠的数据.文中提出的算法首先根据芯片数据鉴定拟南芥花药基因,然后以ATTED-II数据库为基础构建每一个花药基因的共表达网络,最后利用最大团算法从共表达网络中挖掘共表达数据.基于这种方法,系统地分析了每一个拟南芥花药基因的共表达情况,有助于拟南芥花药发育分子机理和基因转录调控的深入研究.实验验证这种方法对拟南芥花药共表达基因的提取十分有效.
運用圖論中最大糰算法,對ATTED-II數據庫中提供的擬南芥共錶達數據進行分析,為進一步研究基因功能提供瞭較為可靠的數據.文中提齣的算法首先根據芯片數據鑒定擬南芥花藥基因,然後以ATTED-II數據庫為基礎構建每一箇花藥基因的共錶達網絡,最後利用最大糰算法從共錶達網絡中挖掘共錶達數據.基于這種方法,繫統地分析瞭每一箇擬南芥花藥基因的共錶達情況,有助于擬南芥花藥髮育分子機理和基因轉錄調控的深入研究.實驗驗證這種方法對擬南芥花藥共錶達基因的提取十分有效.
운용도론중최대단산법,대ATTED-II수거고중제공적의남개공표체수거진행분석,위진일보연구기인공능제공료교위가고적수거.문중제출적산법수선근거심편수거감정의남개화약기인,연후이ATTED-II수거고위기출구건매일개화약기인적공표체망락,최후이용최대단산법종공표체망락중알굴공표체수거.기우저충방법,계통지분석료매일개의남개화약기인적공표체정황,유조우의남개화약발육분자궤리화기인전록조공적심입연구.실험험증저충방법대의남개화약공표체기인적제취십분유효.
