化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2002年
1期
43-48
,共6页
朱丽荔%侯廷军%陈丽蓉%徐筱杰
硃麗荔%侯廷軍%陳麗蓉%徐篠傑
주려려%후정군%진려용%서소걸
表皮生长因子受体%4-苯胺喹唑啉类抑制剂%分子动力学%分子力学%分子对接
錶皮生長因子受體%4-苯胺喹唑啉類抑製劑%分子動力學%分子力學%分子對接
표피생장인자수체%4-분알규서람류억제제%분자동역학%분자역학%분자대접
研究了表皮生长因子受体(EGFR)和4-苯胺喹唑啉类抑制剂之间的相互作用模式.表皮生长因子受体的三维结构通过同源蛋白模建的方法得到,而抑制剂和靶酶结合复合物结构则通过分子力学和分子动力学结合的方法计算得到.从模拟结果得到的抑制剂和靶酶之间的相互作用模式表明范德华相互作用、疏水相互作用以及氢键相互作用对抑制剂的活性都有重要的影响.抑制剂的苯胺部分位于活性口袋的底部,能够与受体残基的非极性侧链产生很强的范德华和疏水相互作用.抑制剂双环上的取代基团也能和活性口袋外部的部分残基形成一定的范德华和疏水性相互作用.而抑制剂喹唑啉环上的氮原子能和周围的残基形成较强的氢键相互作用,对抑制剂的活性有较大的影响.计算得到抑制剂和靶酶之间的非键相互作用能以及抑制剂和靶酶之间的相互作用信息能够很好地解释抑制剂活性和结构的关系,为全新抑制剂的设计提供了重要的结构信息.
研究瞭錶皮生長因子受體(EGFR)和4-苯胺喹唑啉類抑製劑之間的相互作用模式.錶皮生長因子受體的三維結構通過同源蛋白模建的方法得到,而抑製劑和靶酶結閤複閤物結構則通過分子力學和分子動力學結閤的方法計算得到.從模擬結果得到的抑製劑和靶酶之間的相互作用模式錶明範德華相互作用、疏水相互作用以及氫鍵相互作用對抑製劑的活性都有重要的影響.抑製劑的苯胺部分位于活性口袋的底部,能夠與受體殘基的非極性側鏈產生很彊的範德華和疏水相互作用.抑製劑雙環上的取代基糰也能和活性口袋外部的部分殘基形成一定的範德華和疏水性相互作用.而抑製劑喹唑啉環上的氮原子能和週圍的殘基形成較彊的氫鍵相互作用,對抑製劑的活性有較大的影響.計算得到抑製劑和靶酶之間的非鍵相互作用能以及抑製劑和靶酶之間的相互作用信息能夠很好地解釋抑製劑活性和結構的關繫,為全新抑製劑的設計提供瞭重要的結構信息.
연구료표피생장인자수체(EGFR)화4-분알규서람류억제제지간적상호작용모식.표피생장인자수체적삼유결구통과동원단백모건적방법득도,이억제제화파매결합복합물결구칙통과분자역학화분자동역학결합적방법계산득도.종모의결과득도적억제제화파매지간적상호작용모식표명범덕화상호작용、소수상호작용이급경건상호작용대억제제적활성도유중요적영향.억제제적분알부분위우활성구대적저부,능구여수체잔기적비겁성측련산생흔강적범덕화화소수상호작용.억제제쌍배상적취대기단야능화활성구대외부적부분잔기형성일정적범덕화화소수성상호작용.이억제제규서람배상적담원자능화주위적잔기형성교강적경건상호작용,대억제제적활성유교대적영향.계산득도억제제화파매지간적비건상호작용능이급억제제화파매지간적상호작용신식능구흔호지해석억제제활성화결구적관계,위전신억제제적설계제공료중요적결구신식.