CAJ | 학술논문

通过PCR克隆测序首次测定了黑白花奶牛干扰素-τ成熟蛋白的完整基因序列(GenBank登录号:DQ680846、DQ680847),其CDS长度为519 bp,编码含有172个氨基酸的牛干扰素-τ成熟蛋白.对所有牛干扰素-τ序列进行聚类分析,可将其聚为4类,发现了一类新的牛干扰素-τ(τ4)和6种新亚型(τ1e、τ3f、τ3g、τ3h、τ4a、τ4b).DQ680846属于τ4类的一种亚型,标记为τ4a;DQ680847属于τ3类的一种亚型,标记为τ3f.各牛干扰素-τ基因核苷酸序列间的同源性在92.7%～99.8%之间,推导氨基酸序列间的同源性在88.5%～99.4%之间;τ4a、τ3f与其他牛干扰素-τ基因核苷酸序列间的同源性分别在94.0%～97.1%、92.9%～99.6%之间,推导氨基酸序列间的同源性分别在91.4%～96.0%、88.5%～99.4%之间.这一结果反应了牛干扰素-τ基因在进化过程中的高度保守性.二级结构预测发现牛干扰素-τ成熟蛋白是以5个α-螺旋(A-E螺旋)为基础构成的.Asn78、Cys1、Cys29、Cys99、Cys139、Ile143、Lys160和C-末端的11个氨基酸为高度保守区,它们是维持牛干扰素-τ的结构和功能所必需的.
통과PCR극륭측서수차측정료흑백화내우간우소-τ성숙단백적완정기인서렬(GenBank등록호:DQ680846、DQ680847),기CDS장도위519 bp,편마함유172개안기산적우간우소-τ성숙단백.대소유우간우소-τ서렬진행취류분석,가장기취위4류,발현료일류신적우간우소-τ(τ4)화6충신아형(τ1e、τ3f、τ3g、τ3h、τ4a、τ4b).DQ680846속우τ4류적일충아형,표기위τ4a;DQ680847속우τ3류적일충아형,표기위τ3f.각우간우소-τ기인핵감산서렬간적동원성재92.7%～99.8%지간,추도안기산서렬간적동원성재88.5%～99.4%지간;τ4a、τ3f여기타우간우소-τ기인핵감산서렬간적동원성분별재94.0%～97.1%、92.9%～99.6%지간,추도안기산서렬간적동원성분별재91.4%～96.0%、88.5%～99.4%지간.저일결과반응료우간우소-τ기인재진화과정중적고도보수성.이급결구예측발현우간우소-τ성숙단백시이5개α-라선(A-E라선)위기출구성적.Asn78、Cys1、Cys29、Cys99、Cys139、Ile143、Lys160화C-말단적11개안기산위고도보수구,타문시유지우간우소-τ적결구화공능소필수적.