生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
3期
254-257,262
,共5页
CpG岛%进化保守分析%CpG岛起源%转座子
CpG島%進化保守分析%CpG島起源%轉座子
CpG도%진화보수분석%CpG도기원%전좌자
为了研究CpG岛产生和消失机制以及位于基因启动子区域外的CpG岛保守性等问题,我们通过序列比对和进化保守性分析等方法,分析在人类和小鼠中保守的基因上的CpG岛.结果显示已有保守序列的突变以及序列插入删除是CpG岛产生和消失的主要原因,进一步分析发现52%的在小鼠基因组上保守序列完全缺失的CpG岛位于两个转座子之间,提示转座子所介导的序列插入是CpG岛形成和消失的重要原因.人类基因组上在启动子区域外的CpG岛中约有79%为新产生的CpG岛,显著高于启动子区域内新产生的CpG岛比例 (41%).GO分析表明与这些CpG岛相关的部分基因与神经系统发育显著相关,提示新产生的CpG岛参与神经发育过程.
為瞭研究CpG島產生和消失機製以及位于基因啟動子區域外的CpG島保守性等問題,我們通過序列比對和進化保守性分析等方法,分析在人類和小鼠中保守的基因上的CpG島.結果顯示已有保守序列的突變以及序列插入刪除是CpG島產生和消失的主要原因,進一步分析髮現52%的在小鼠基因組上保守序列完全缺失的CpG島位于兩箇轉座子之間,提示轉座子所介導的序列插入是CpG島形成和消失的重要原因.人類基因組上在啟動子區域外的CpG島中約有79%為新產生的CpG島,顯著高于啟動子區域內新產生的CpG島比例 (41%).GO分析錶明與這些CpG島相關的部分基因與神經繫統髮育顯著相關,提示新產生的CpG島參與神經髮育過程.
위료연구CpG도산생화소실궤제이급위우기인계동자구역외적CpG도보수성등문제,아문통과서렬비대화진화보수성분석등방법,분석재인류화소서중보수적기인상적CpG도.결과현시이유보수서렬적돌변이급서렬삽입산제시CpG도산생화소실적주요원인,진일보분석발현52%적재소서기인조상보수서렬완전결실적CpG도위우량개전좌자지간,제시전좌자소개도적서렬삽입시CpG도형성화소실적중요원인.인류기인조상재계동자구역외적CpG도중약유79%위신산생적CpG도,현저고우계동자구역내신산생적CpG도비례 (41%).GO분석표명여저사CpG도상관적부분기인여신경계통발육현저상관,제시신산생적CpG도삼여신경발육과정.
