临床与实验病理学杂志
臨床與實驗病理學雜誌
림상여실험병이학잡지
CHINESE JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL PATHOLOGY
2005年
6期
701-706
,共6页
宋波%王波%崔晓楠%侯力%周春辉%郑仁恕%李晓枫%唐建武
宋波%王波%崔曉楠%侯力%週春輝%鄭仁恕%李曉楓%唐建武
송파%왕파%최효남%후력%주춘휘%정인서%리효풍%당건무
肝肿瘤%肿瘤转移%Hca-F%Hca-P%基因芯片%小鼠
肝腫瘤%腫瘤轉移%Hca-F%Hca-P%基因芯片%小鼠
간종류%종류전이%Hca-F%Hca-P%기인심편%소서
目的采用表达芯片比较高、低淋巴道转移力小鼠肝癌腹水型细胞株Hca-F和Hca-P的基因表达谱,以筛选出与肿瘤淋巴道转移相关的基因.方法分别提取Hca-F和Hca-P细胞的总RNA,反转录合成生物素标记的cRNA探针,并与Affymetrix GeneChip MOE430A(包括22 690个转录本,对应于约14 500个小鼠已知基因和4 371个EST)杂交,检测结果利用生物信息学进行分析.结果 Hca-F和Hca-P相比,在14 500个已知基因中,有901个(6.2%)表达上调幅度≥2倍;在4 371个EST中,有129个(3%)上调幅度≥2倍.公布了差异表达≥8倍的37个基因并根据Gene Ontology(GO)分类和TreeView分析,按照其参与的生物学过程和具有的分子功能进行了功能分类.其中有19个基因参与了组织发生、细胞黏附、信号转导、细胞生长、分化及代谢等的生物学过程,29个基因分别具有转运、移动、蛋白激酶、蛋白结合及受体活性等分子功能,7个基因的生物学功能尚不清楚.结论表达芯片检测与肿瘤淋巴道转移模型相结合,为肿瘤转移研究提供新方法、新思路,一些过量表达的基因将为肿瘤转移机制的研究提供新线索.
目的採用錶達芯片比較高、低淋巴道轉移力小鼠肝癌腹水型細胞株Hca-F和Hca-P的基因錶達譜,以篩選齣與腫瘤淋巴道轉移相關的基因.方法分彆提取Hca-F和Hca-P細胞的總RNA,反轉錄閤成生物素標記的cRNA探針,併與Affymetrix GeneChip MOE430A(包括22 690箇轉錄本,對應于約14 500箇小鼠已知基因和4 371箇EST)雜交,檢測結果利用生物信息學進行分析.結果 Hca-F和Hca-P相比,在14 500箇已知基因中,有901箇(6.2%)錶達上調幅度≥2倍;在4 371箇EST中,有129箇(3%)上調幅度≥2倍.公佈瞭差異錶達≥8倍的37箇基因併根據Gene Ontology(GO)分類和TreeView分析,按照其參與的生物學過程和具有的分子功能進行瞭功能分類.其中有19箇基因參與瞭組織髮生、細胞黏附、信號轉導、細胞生長、分化及代謝等的生物學過程,29箇基因分彆具有轉運、移動、蛋白激酶、蛋白結閤及受體活性等分子功能,7箇基因的生物學功能尚不清楚.結論錶達芯片檢測與腫瘤淋巴道轉移模型相結閤,為腫瘤轉移研究提供新方法、新思路,一些過量錶達的基因將為腫瘤轉移機製的研究提供新線索.
목적채용표체심편비교고、저림파도전이력소서간암복수형세포주Hca-F화Hca-P적기인표체보,이사선출여종류림파도전이상관적기인.방법분별제취Hca-F화Hca-P세포적총RNA,반전록합성생물소표기적cRNA탐침,병여Affymetrix GeneChip MOE430A(포괄22 690개전록본,대응우약14 500개소서이지기인화4 371개EST)잡교,검측결과이용생물신식학진행분석.결과 Hca-F화Hca-P상비,재14 500개이지기인중,유901개(6.2%)표체상조폭도≥2배;재4 371개EST중,유129개(3%)상조폭도≥2배.공포료차이표체≥8배적37개기인병근거Gene Ontology(GO)분류화TreeView분석,안조기삼여적생물학과정화구유적분자공능진행료공능분류.기중유19개기인삼여료조직발생、세포점부、신호전도、세포생장、분화급대사등적생물학과정,29개기인분별구유전운、이동、단백격매、단백결합급수체활성등분자공능,7개기인적생물학공능상불청초.결론표체심편검측여종류림파도전이모형상결합,위종류전이연구제공신방법、신사로,일사과량표체적기인장위종류전이궤제적연구제공신선색.
