江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
6期
29-32
,共4页
王俊生%范小芳%李成伟%谭光轩
王俊生%範小芳%李成偉%譚光軒
왕준생%범소방%리성위%담광헌
小麦%U-box domain蛋白基因%电子克隆%生物信息学
小麥%U-box domain蛋白基因%電子剋隆%生物信息學
소맥%U-box domain단백기인%전자극륭%생물신식학
用电子克隆方法获得了1个小麦U - box蛋白基因Ta- UBXI,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、基本理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析.结果表明:小麦Ta - UBXl基因全长2059 bp,具有完整的ORF编码框,编码553个氨基酸;在N端存在1个显著的UBX保守结构域,该蛋白序列不存在跨膜区或信号肽;生物信息学分析表明,在序列组成、高级结构及活性位点等方面,与其他禾本科植物的同类U - box蛋白具有高度的相似性.
用電子剋隆方法穫得瞭1箇小麥U - box蛋白基因Ta- UBXI,採用生物信息學方法,對該基因編碼蛋白從氨基痠組成、基本理化性質、跨膜結構域、疏水性/親水性、亞細胞定位、高級結構及功能域等方麵進行瞭預測和分析.結果錶明:小麥Ta - UBXl基因全長2059 bp,具有完整的ORF編碼框,編碼553箇氨基痠;在N耑存在1箇顯著的UBX保守結構域,該蛋白序列不存在跨膜區或信號肽;生物信息學分析錶明,在序列組成、高級結構及活性位點等方麵,與其他禾本科植物的同類U - box蛋白具有高度的相似性.
용전자극륭방법획득료1개소맥U - box단백기인Ta- UBXI,채용생물신식학방법,대해기인편마단백종안기산조성、기본이화성질、과막결구역、소수성/친수성、아세포정위、고급결구급공능역등방면진행료예측화분석.결과표명:소맥Ta - UBXl기인전장2059 bp,구유완정적ORF편마광,편마553개안기산;재N단존재1개현저적UBX보수결구역,해단백서렬불존재과막구혹신호태;생물신식학분석표명,재서렬조성、고급결구급활성위점등방면,여기타화본과식물적동류U - box단백구유고도적상사성.