四川大学学报(自然科学版)
四川大學學報(自然科學版)
사천대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF SICHUAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2010年
6期
1417-1422
,共6页
蔡浩洋%李校%徐加豹%张义正
蔡浩洋%李校%徐加豹%張義正
채호양%리교%서가표%장의정
水稻%蛋白质相互作用%同源映射%蛋白质功能预测
水稻%蛋白質相互作用%同源映射%蛋白質功能預測
수도%단백질상호작용%동원영사%단백질공능예측
通过同源映射的方法,利用6个模式物种的蛋白质相互作用数据预测水稻的蛋白质相互作用网络.预测到水稻中有4483个蛋白质参与了24942个蛋白质相互作用.通过GO注释,结构域相互作用,基因共表达等3个证据评估预测网络的质量,并对网络进行了拓扑属性分析.结果表明水稻的蛋白质相互作用网络符合scale-free属性.通过对网络中功能模块的分析,可以预测蛋白质的功能和亚细胞定位信息.
通過同源映射的方法,利用6箇模式物種的蛋白質相互作用數據預測水稻的蛋白質相互作用網絡.預測到水稻中有4483箇蛋白質參與瞭24942箇蛋白質相互作用.通過GO註釋,結構域相互作用,基因共錶達等3箇證據評估預測網絡的質量,併對網絡進行瞭拓撲屬性分析.結果錶明水稻的蛋白質相互作用網絡符閤scale-free屬性.通過對網絡中功能模塊的分析,可以預測蛋白質的功能和亞細胞定位信息.
통과동원영사적방법,이용6개모식물충적단백질상호작용수거예측수도적단백질상호작용망락.예측도수도중유4483개단백질삼여료24942개단백질상호작용.통과GO주석,결구역상호작용,기인공표체등3개증거평고예측망락적질량,병대망락진행료탁복속성분석.결과표명수도적단백질상호작용망락부합scale-free속성.통과대망락중공능모괴적분석,가이예측단백질적공능화아세포정위신식.