计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2008年
12期
1511-1516
,共6页
钱力%沈勇%王亚学%郑康成
錢力%瀋勇%王亞學%鄭康成
전력%침용%왕아학%정강성
雌二醇衍生物%人雌激素受体%3D-QSAR%分子对接
雌二醇衍生物%人雌激素受體%3D-QSAR%分子對接
자이순연생물%인자격소수체%3D-QSAR%분자대접
采用比较分子力场方法(CoMFA)及分子对接方法对一系列雌二醇衍生物的3D-QSAR及其与受体作用方式进行研究,建立了3D-QSAR的CoMFA模型,获得了化合物的相对亲合力RBA(Relative Binding Affinity)与静电场及立体场分布之间的关系;CoMFA模型的统计学参数为:q2=0.667,r2=0.939,sD=0.280,F=49.033,立体场与静电场的贡献分别为56.8%和41.6%.相对亲合力小的化合物一般带有较大的取代基,其对接能量得分较低;相对亲合力大的化合物一般带有较小的取代基,其对接能量得分较高.化合物的对接能量得分和相对亲合力之间有良好的线性关系,其线性相关系数R为0.890.活性口袋周围的环境也与3D-QSAR的立体场分布相匹配.对接结果还显示这类化合物和雌激素的结合主要是通过氢键作用来实现,即3-OH与R394上的氨基以及17-OH与受体残基H524咪唑环上的氮形成的氢键.
採用比較分子力場方法(CoMFA)及分子對接方法對一繫列雌二醇衍生物的3D-QSAR及其與受體作用方式進行研究,建立瞭3D-QSAR的CoMFA模型,穫得瞭化閤物的相對親閤力RBA(Relative Binding Affinity)與靜電場及立體場分佈之間的關繫;CoMFA模型的統計學參數為:q2=0.667,r2=0.939,sD=0.280,F=49.033,立體場與靜電場的貢獻分彆為56.8%和41.6%.相對親閤力小的化閤物一般帶有較大的取代基,其對接能量得分較低;相對親閤力大的化閤物一般帶有較小的取代基,其對接能量得分較高.化閤物的對接能量得分和相對親閤力之間有良好的線性關繫,其線性相關繫數R為0.890.活性口袋週圍的環境也與3D-QSAR的立體場分佈相匹配.對接結果還顯示這類化閤物和雌激素的結閤主要是通過氫鍵作用來實現,即3-OH與R394上的氨基以及17-OH與受體殘基H524咪唑環上的氮形成的氫鍵.
채용비교분자력장방법(CoMFA)급분자대접방법대일계렬자이순연생물적3D-QSAR급기여수체작용방식진행연구,건립료3D-QSAR적CoMFA모형,획득료화합물적상대친합력RBA(Relative Binding Affinity)여정전장급입체장분포지간적관계;CoMFA모형적통계학삼수위:q2=0.667,r2=0.939,sD=0.280,F=49.033,입체장여정전장적공헌분별위56.8%화41.6%.상대친합력소적화합물일반대유교대적취대기,기대접능량득분교저;상대친합력대적화합물일반대유교소적취대기,기대접능량득분교고.화합물적대접능량득분화상대친합력지간유량호적선성관계,기선성상관계수R위0.890.활성구대주위적배경야여3D-QSAR적입체장분포상필배.대접결과환현시저류화합물화자격소적결합주요시통과경건작용래실현,즉3-OH여R394상적안기이급17-OH여수체잔기H524미서배상적담형성적경건.
