CAJ | 학술논문

通过RT-PCR和RACE PCR技术,从海参(Stichopus japonicus)体壁中克隆得到一种溶菌酶基因(GenBank:EF036468).生物信息软件分析表明,其中全长cDNA为713 bp,5'非编码区(UTR)246bp,3'UTR 29 bp,开放阅读框438 bp,编码145个氨基酸,包括溶菌酶成熟肽124个氨基酸和信号肽21个氨基酸.对海参溶菌酶与多种无脊椎动物的c、g和i型溶菌酶进行分析比较,发现它与i型溶菌酶有较高的同源性,并具有i型溶菌酶高度保守的2个活性位点,即Glu34和Ser50.活性位点附近具有i型溶菌酶的一段特有的氨基酸保守序列MDVGSLSCG(P/Y)(Y/F)QIK,所以推断克隆的海参溶菌酶为i型.另外,通过搜索蛋白保守结构域数据库,发现海参溶菌酶与医用水蛭失稳酶相似性最高,并且这2个酶的三级结构模型也极其相似.因此推测,海参i型溶菌酶具有双功能特性,既能作用于细菌细胞壁的糖苷键使细胞裂解,又具有失稳酶的一些生化功能,能够水解纤维蛋白,这些特点在海参自溶过程中发挥重要的作用.
통과RT-PCR화RACE PCR기술,종해삼(Stichopus japonicus)체벽중극륭득도일충용균매기인(GenBank:EF036468).생물신식연건분석표명,기중전장cDNA위713 bp,5'비편마구(UTR)246bp,3'UTR 29 bp,개방열독광438 bp,편마145개안기산,포괄용균매성숙태124개안기산화신호태21개안기산.대해삼용균매여다충무척추동물적c、g화i형용균매진행분석비교,발현타여i형용균매유교고적동원성,병구유i형용균매고도보수적2개활성위점,즉Glu34화Ser50.활성위점부근구유i형용균매적일단특유적안기산보수서렬MDVGSLSCG(P/Y)(Y/F)QIK,소이추단극륭적해삼용균매위i형.령외,통과수색단백보수결구역수거고,발현해삼용균매여의용수질실은매상사성최고,병차저2개매적삼급결구모형야겁기상사.인차추측,해삼i형용균매구유쌍공능특성,기능작용우세균세포벽적당감건사세포렬해,우구유실은매적일사생화공능,능구수해섬유단백,저사특점재해삼자용과정중발휘중요적작용.