中国组织工程研究
中國組織工程研究
중국조직공정연구
Journal of Clinical Rehabilitative Tissue Engineering Research
2012年
23期
4259-4262
,共4页
神经系统多梳蛋白1%染色质免疫沉淀%全基因组%结合靶点分析%干细胞调控因子
神經繫統多梳蛋白1%染色質免疫沉澱%全基因組%結閤靶點分析%榦細胞調控因子
신경계통다소단백1%염색질면역침정%전기인조%결합파점분석%간세포조공인자
背景:在胚胎发育早期神经系统高表达的多梳蛋白家族成员神经系统多梳蛋白1具有明确转录抑制作用.最近研究表明,神经系统多梳蛋白1可能是一个有别于同源基因Bmi1的新的神经干细胞调控因子.目的:检测体外神经细胞分化模型小鼠畸胎瘤P19细胞中神经发育相关表观遗传调控因子神经系统多梳蛋白1在基因组上的结合靶点.方法:扩增未分化状态的小鼠畸胎瘤P19细胞系(内源性高表达神经系统多梳蛋白1基因),使用兔源抗神经系统多梳蛋白1多克隆抗体进行P19细胞的染色质免疫沉淀实验,并结合采用高通量芯片检测技术(ChIP-on-chip)检测捕获靶基因序列,最后利用生物信息学在线软件分析神经系统多梳蛋白1结合靶点临近基因功能的分类特点.结果与结论:筛选出约1 280个神经系统多梳蛋白1结合靶点,靶点临近或所在基因的功能主要与分化、发育、转录及其调节、神经发生等密切相关.提示全基因组结合靶点分析可有效揭示神经系统多梳蛋白1基因在体外神经干细胞分化模型P19细胞中结合并可能参与调控的靶基因谱的分布特点,有利于下一步深入开展干细胞调控相关因子神经系统多梳蛋白1的下游信号通路研究.
揹景:在胚胎髮育早期神經繫統高錶達的多梳蛋白傢族成員神經繫統多梳蛋白1具有明確轉錄抑製作用.最近研究錶明,神經繫統多梳蛋白1可能是一箇有彆于同源基因Bmi1的新的神經榦細胞調控因子.目的:檢測體外神經細胞分化模型小鼠畸胎瘤P19細胞中神經髮育相關錶觀遺傳調控因子神經繫統多梳蛋白1在基因組上的結閤靶點.方法:擴增未分化狀態的小鼠畸胎瘤P19細胞繫(內源性高錶達神經繫統多梳蛋白1基因),使用兔源抗神經繫統多梳蛋白1多剋隆抗體進行P19細胞的染色質免疫沉澱實驗,併結閤採用高通量芯片檢測技術(ChIP-on-chip)檢測捕穫靶基因序列,最後利用生物信息學在線軟件分析神經繫統多梳蛋白1結閤靶點臨近基因功能的分類特點.結果與結論:篩選齣約1 280箇神經繫統多梳蛋白1結閤靶點,靶點臨近或所在基因的功能主要與分化、髮育、轉錄及其調節、神經髮生等密切相關.提示全基因組結閤靶點分析可有效揭示神經繫統多梳蛋白1基因在體外神經榦細胞分化模型P19細胞中結閤併可能參與調控的靶基因譜的分佈特點,有利于下一步深入開展榦細胞調控相關因子神經繫統多梳蛋白1的下遊信號通路研究.
배경:재배태발육조기신경계통고표체적다소단백가족성원신경계통다소단백1구유명학전록억제작용.최근연구표명,신경계통다소단백1가능시일개유별우동원기인Bmi1적신적신경간세포조공인자.목적:검측체외신경세포분화모형소서기태류P19세포중신경발육상관표관유전조공인자신경계통다소단백1재기인조상적결합파점.방법:확증미분화상태적소서기태류P19세포계(내원성고표체신경계통다소단백1기인),사용토원항신경계통다소단백1다극륭항체진행P19세포적염색질면역침정실험,병결합채용고통량심편검측기술(ChIP-on-chip)검측포획파기인서렬,최후이용생물신식학재선연건분석신경계통다소단백1결합파점림근기인공능적분류특점.결과여결론:사선출약1 280개신경계통다소단백1결합파점,파점림근혹소재기인적공능주요여분화、발육、전록급기조절、신경발생등밀절상관.제시전기인조결합파점분석가유효게시신경계통다소단백1기인재체외신경간세포분화모형P19세포중결합병가능삼여조공적파기인보적분포특점,유리우하일보심입개전간세포조공상관인자신경계통다소단백1적하유신호통로연구.