海洋渔业
海洋漁業
해양어업
MARINE FISHERIES
2012年
3期
241-248
,共8页
郭大庆%施志仪%轩兴荣%李巍
郭大慶%施誌儀%軒興榮%李巍
곽대경%시지의%헌흥영%리외
西伯利亚鲟%CXCR7%cDNA克隆%序列分析%基因表达
西伯利亞鱘%CXCR7%cDNA剋隆%序列分析%基因錶達
서백리아심%CXCR7%cDNA극륭%서렬분석%기인표체
采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),首次克隆了西伯利亚鲟(Acipenser baerii)的CXCR7a和CXCR7b基因的全长cDNA.CXCR7a的cDNA全长为2 325 bp(登录号为:JQ034508),包括207 bp的5 '端非翻译区(UTR)、可编码362个氨基酸的1 086 bp的开放阅读框(ORF)及包括poly(A)尾巴在内的大小为1 032 bp的3 '端非翻译区(UTR)；CXCR7b的cDNA全长为2 423 bp(登录号为:JQ034509),包括209 bp的5'端非翻译区(UTR)、可编码370个氨基酸的1 110 bp的开放阅读框(ORF)及包括poly(A)尾巴在内的大小为1 104bp的3'端非翻译区(UTR),并对它们编码的蛋白质序列的分子特征进行了分析.氨基酸序列相似性(similarity)分析表明,CXCR7a与人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)、非洲爪蟾(Xenopus laevis)、斑马鱼(Danio rerio)的CXCR7相似性分别为82.6％、81.4％、80.9％、81.0％；CXCR7b与人、小鼠、非洲爪蟾、斑马鱼的CXCR7相似性分别为82.9％、82.3％、80.8％、82.5％；西伯利亚鲟CXCR7a与其CXCR7b的相似性最高为96.5％.系统进化树分析显示,西伯利亚鲟与斑马鱼聚为一簇,两栖类聚为一簇,其它高等脊椎动物再进行聚类.对CXCR7a和CXCR7b在各发育时期胚胎及仔鱼的表达状况分别进行定性分析表明,CXCR7a在除卵裂期、囊胚期的胚胎外,其在原肠胚中期至出膜1d的仔鱼的各时期中均具有表达,CXCR7b在卵裂期至出膜1d的仔鱼的各时期中均具有表达.另外,从基因组DNA水平上表明CXCR7a和CXCR7b来自不同的基因拷贝.这些结果为进一步研究CXCR7在西伯利亚鲟侧线系统发育中的作用提供了新的基础资料.
採用RT-PCR和cDNA末耑快速擴增技術(rapid amplification of cDNA ends,RACE),首次剋隆瞭西伯利亞鱘(Acipenser baerii)的CXCR7a和CXCR7b基因的全長cDNA.CXCR7a的cDNA全長為2 325 bp(登錄號為:JQ034508),包括207 bp的5 '耑非翻譯區(UTR)、可編碼362箇氨基痠的1 086 bp的開放閱讀框(ORF)及包括poly(A)尾巴在內的大小為1 032 bp的3 '耑非翻譯區(UTR)；CXCR7b的cDNA全長為2 423 bp(登錄號為:JQ034509),包括209 bp的5'耑非翻譯區(UTR)、可編碼370箇氨基痠的1 110 bp的開放閱讀框(ORF)及包括poly(A)尾巴在內的大小為1 104bp的3'耑非翻譯區(UTR),併對它們編碼的蛋白質序列的分子特徵進行瞭分析.氨基痠序列相似性(similarity)分析錶明,CXCR7a與人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)、非洲爪蟾(Xenopus laevis)、斑馬魚(Danio rerio)的CXCR7相似性分彆為82.6％、81.4％、80.9％、81.0％；CXCR7b與人、小鼠、非洲爪蟾、斑馬魚的CXCR7相似性分彆為82.9％、82.3％、80.8％、82.5％；西伯利亞鱘CXCR7a與其CXCR7b的相似性最高為96.5％.繫統進化樹分析顯示,西伯利亞鱘與斑馬魚聚為一簇,兩棲類聚為一簇,其它高等脊椎動物再進行聚類.對CXCR7a和CXCR7b在各髮育時期胚胎及仔魚的錶達狀況分彆進行定性分析錶明,CXCR7a在除卵裂期、囊胚期的胚胎外,其在原腸胚中期至齣膜1d的仔魚的各時期中均具有錶達,CXCR7b在卵裂期至齣膜1d的仔魚的各時期中均具有錶達.另外,從基因組DNA水平上錶明CXCR7a和CXCR7b來自不同的基因拷貝.這些結果為進一步研究CXCR7在西伯利亞鱘側線繫統髮育中的作用提供瞭新的基礎資料.
채용RT-PCR화cDNA말단쾌속확증기술(rapid amplification of cDNA ends,RACE),수차극륭료서백리아심(Acipenser baerii)적CXCR7a화CXCR7b기인적전장cDNA.CXCR7a적cDNA전장위2 325 bp(등록호위:JQ034508),포괄207 bp적5 '단비번역구(UTR)、가편마362개안기산적1 086 bp적개방열독광(ORF)급포괄poly(A)미파재내적대소위1 032 bp적3 '단비번역구(UTR)；CXCR7b적cDNA전장위2 423 bp(등록호위:JQ034509),포괄209 bp적5'단비번역구(UTR)、가편마370개안기산적1 110 bp적개방열독광(ORF)급포괄poly(A)미파재내적대소위1 104bp적3'단비번역구(UTR),병대타문편마적단백질서렬적분자특정진행료분석.안기산서렬상사성(similarity)분석표명,CXCR7a여인(Homo sapiens)、소서(Mus musculus)、비주조섬(Xenopus laevis)、반마어(Danio rerio)적CXCR7상사성분별위82.6％、81.4％、80.9％、81.0％；CXCR7b여인、소서、비주조섬、반마어적CXCR7상사성분별위82.9％、82.3％、80.8％、82.5％；서백리아심CXCR7a여기CXCR7b적상사성최고위96.5％.계통진화수분석현시,서백리아심여반마어취위일족,량서류취위일족,기타고등척추동물재진행취류.대CXCR7a화CXCR7b재각발육시기배태급자어적표체상황분별진행정성분석표명,CXCR7a재제란렬기、낭배기적배태외,기재원장배중기지출막1d적자어적각시기중균구유표체,CXCR7b재란렬기지출막1d적자어적각시기중균구유표체.령외,종기인조DNA수평상표명CXCR7a화CXCR7b래자불동적기인고패.저사결과위진일보연구CXCR7재서백리아심측선계통발육중적작용제공료신적기출자료.
