生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
4期
325-329
,共5页
酵母基因%转录频率%启动子%Markov模型
酵母基因%轉錄頻率%啟動子%Markov模型
효모기인%전록빈솔%계동자%Markov모형
不同基因的转录效率一般会有差异,启动子序列的组织结构可能是造成差异的原因之一.本文分别基于出现频率、Markov模型以及加权Markov模型计算出所有6碱基片段(6-mer)在不同转录频率的酵母基因启动子序列中的分布,然后利用最大最小贴近度方法分析这些基因启动子序列结构的差异情况.结果表明,酵母基因的转录频率与启动子序列结构的确有关联,转录频率相差较大的基因,它们的启动子序列结构差异一般也较大.统计分析还表明,高阶(3阶和4阶)加权Markov模型可以更有效地反映基因启动子序列的结构特征.
不同基因的轉錄效率一般會有差異,啟動子序列的組織結構可能是造成差異的原因之一.本文分彆基于齣現頻率、Markov模型以及加權Markov模型計算齣所有6堿基片段(6-mer)在不同轉錄頻率的酵母基因啟動子序列中的分佈,然後利用最大最小貼近度方法分析這些基因啟動子序列結構的差異情況.結果錶明,酵母基因的轉錄頻率與啟動子序列結構的確有關聯,轉錄頻率相差較大的基因,它們的啟動子序列結構差異一般也較大.統計分析還錶明,高階(3階和4階)加權Markov模型可以更有效地反映基因啟動子序列的結構特徵.
불동기인적전록효솔일반회유차이,계동자서렬적조직결구가능시조성차이적원인지일.본문분별기우출현빈솔、Markov모형이급가권Markov모형계산출소유6감기편단(6-mer)재불동전록빈솔적효모기인계동자서렬중적분포,연후이용최대최소첩근도방법분석저사기인계동자서렬결구적차이정황.결과표명,효모기인적전록빈솔여계동자서렬결구적학유관련,전록빈솔상차교대적기인,타문적계동자서렬결구차이일반야교대.통계분석환표명,고계(3계화4계)가권Markov모형가이경유효지반영기인계동자서렬적결구특정.
