生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2011年
7期
82-87
,共6页
刘亚玲%王俊杰%云锦凤%赵彦%侯永霞
劉亞玲%王俊傑%雲錦鳳%趙彥%侯永霞
류아령%왕준걸%운금봉%조언%후영하
黄花苜蓿%LEA3基因%克隆%生物信息学
黃花苜蓿%LEA3基因%剋隆%生物信息學
황화목숙%LEA3기인%극륭%생물신식학
根据紫花苜蓿LEA3-1 mRNA(EU665182)的cDNA序列,设计1对特异引物,以经过ABA干旱胁迫处理的黄花苜蓿为材料,提取总RNA.采用RT-PCR方法克隆获得了747 bp的cDNA片段,命名为MfLEA3-1(GenBank登录号:HQ327439).推测该序列编码了248个氨基酸,这些氨基酸主要由10.1％苏氨酸(Thr)、24.6％丙氨酸(Ala)、17.7％赖氨酸(Lys)和12.9％天冬氨酸(Asp)组成,不含有半胱氨酸和色氨酸,这与其他物种LEA蛋白成分非常接近.该氨基酸序列中存在13个11-mer重复序列,根据第3组蛋白分类标准,MfLEA3-1蛋白比较接近于type Ⅰ,但是11-mer重复中残基分布与type Ⅰ有所不同,推测MfLEA3-1蛋白属于新的第3组LEA蛋白类型.黄花苜蓿中成功获得了LEA3基因片段,为最终克隆黄花苜蓿LEA3基因序列全长奠定基础.
根據紫花苜蓿LEA3-1 mRNA(EU665182)的cDNA序列,設計1對特異引物,以經過ABA榦旱脅迫處理的黃花苜蓿為材料,提取總RNA.採用RT-PCR方法剋隆穫得瞭747 bp的cDNA片段,命名為MfLEA3-1(GenBank登錄號:HQ327439).推測該序列編碼瞭248箇氨基痠,這些氨基痠主要由10.1％囌氨痠(Thr)、24.6％丙氨痠(Ala)、17.7％賴氨痠(Lys)和12.9％天鼕氨痠(Asp)組成,不含有半胱氨痠和色氨痠,這與其他物種LEA蛋白成分非常接近.該氨基痠序列中存在13箇11-mer重複序列,根據第3組蛋白分類標準,MfLEA3-1蛋白比較接近于type Ⅰ,但是11-mer重複中殘基分佈與type Ⅰ有所不同,推測MfLEA3-1蛋白屬于新的第3組LEA蛋白類型.黃花苜蓿中成功穫得瞭LEA3基因片段,為最終剋隆黃花苜蓿LEA3基因序列全長奠定基礎.
근거자화목숙LEA3-1 mRNA(EU665182)적cDNA서렬,설계1대특이인물,이경과ABA간한협박처리적황화목숙위재료,제취총RNA.채용RT-PCR방법극륭획득료747 bp적cDNA편단,명명위MfLEA3-1(GenBank등록호:HQ327439).추측해서렬편마료248개안기산,저사안기산주요유10.1％소안산(Thr)、24.6％병안산(Ala)、17.7％뢰안산(Lys)화12.9％천동안산(Asp)조성,불함유반광안산화색안산,저여기타물충LEA단백성분비상접근.해안기산서렬중존재13개11-mer중복서렬,근거제3조단백분류표준,MfLEA3-1단백비교접근우type Ⅰ,단시11-mer중복중잔기분포여type Ⅰ유소불동,추측MfLEA3-1단백속우신적제3조LEA단백류형.황화목숙중성공획득료LEA3기인편단,위최종극륭황화목숙LEA3기인서렬전장전정기출.
