中国人兽共患病杂志
中國人獸共患病雜誌
중국인수공환병잡지
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2003年
3期
17-21
,共5页
张怡轩%郭晓奎%茅翔%缪有刚%吴春福%赵国屏
張怡軒%郭曉奎%茅翔%繆有剛%吳春福%趙國屏
장이헌%곽효규%모상%무유강%오춘복%조국병
钩端螺旋体%血小板激活因子乙酰化酶%出血%生物信息学
鉤耑螺鏇體%血小闆激活因子乙酰化酶%齣血%生物信息學
구단라선체%혈소판격활인자을선화매%출혈%생물신식학
目的由于钩端螺旋体病的主要特征之一是组织器官广泛性出血,出血部位发生在黏膜、脏器、浆膜和皮肤等处,严重者出现大面积肺弥散性出血、咳血,是危重钩端螺旋体病早期最常见的死因,其致病机理仍不清楚.本文使用生物信息学软件分析钩端螺旋体基因LA2144(血小板激活因子乙酰化酶,PafAH)所编码蛋白的结构和功能,并探讨其在致病过程中的作用.方法使用NCBI,Swissprot/TrEMBL,ProDom,Pfam,Jpred2,SWISS-MODEL,TMpred,SignalP,ClustW对问号钩端螺旋体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因诠释,编码蛋白进行在线分析,并使用Bioedit软件进行氨基酸同源性比较分析.结果确定了问号钩端螺旋体黄疸出血型赖株血小板激活因子乙酰化酶基因,该基因编码蛋白质与哺乳动物pafAH在一级结构上相似性达42%,以牛脑pafAH(Ib)γ亚基(1WAB/PDB)为模件模拟该蛋白三级结构,发现两者立体结构与非常相似,催化位点完全相同,均由Ser-His-Asp组成催化三合体.结论该基因可能与钩体染色体所编码的胶原酶基因,溶菌酶基因,YopM基因,VwA基因协同在钩端螺旋体病出血过程中起作用,最终导致弥散性出血和咳血.
目的由于鉤耑螺鏇體病的主要特徵之一是組織器官廣汎性齣血,齣血部位髮生在黏膜、髒器、漿膜和皮膚等處,嚴重者齣現大麵積肺瀰散性齣血、咳血,是危重鉤耑螺鏇體病早期最常見的死因,其緻病機理仍不清楚.本文使用生物信息學軟件分析鉤耑螺鏇體基因LA2144(血小闆激活因子乙酰化酶,PafAH)所編碼蛋白的結構和功能,併探討其在緻病過程中的作用.方法使用NCBI,Swissprot/TrEMBL,ProDom,Pfam,Jpred2,SWISS-MODEL,TMpred,SignalP,ClustW對問號鉤耑螺鏇體黃疸齣血型賴株全基因組ORF基因詮釋,編碼蛋白進行在線分析,併使用Bioedit軟件進行氨基痠同源性比較分析.結果確定瞭問號鉤耑螺鏇體黃疸齣血型賴株血小闆激活因子乙酰化酶基因,該基因編碼蛋白質與哺乳動物pafAH在一級結構上相似性達42%,以牛腦pafAH(Ib)γ亞基(1WAB/PDB)為模件模擬該蛋白三級結構,髮現兩者立體結構與非常相似,催化位點完全相同,均由Ser-His-Asp組成催化三閤體.結論該基因可能與鉤體染色體所編碼的膠原酶基因,溶菌酶基因,YopM基因,VwA基因協同在鉤耑螺鏇體病齣血過程中起作用,最終導緻瀰散性齣血和咳血.
목적유우구단라선체병적주요특정지일시조직기관엄범성출혈,출혈부위발생재점막、장기、장막화피부등처,엄중자출현대면적폐미산성출혈、해혈,시위중구단라선체병조기최상견적사인,기치병궤리잉불청초.본문사용생물신식학연건분석구단라선체기인LA2144(혈소판격활인자을선화매,PafAH)소편마단백적결구화공능,병탐토기재치병과정중적작용.방법사용NCBI,Swissprot/TrEMBL,ProDom,Pfam,Jpred2,SWISS-MODEL,TMpred,SignalP,ClustW대문호구단라선체황달출혈형뢰주전기인조ORF기인전석,편마단백진행재선분석,병사용Bioedit연건진행안기산동원성비교분석.결과학정료문호구단라선체황달출혈형뢰주혈소판격활인자을선화매기인,해기인편마단백질여포유동물pafAH재일급결구상상사성체42%,이우뇌pafAH(Ib)γ아기(1WAB/PDB)위모건모의해단백삼급결구,발현량자입체결구여비상상사,최화위점완전상동,균유Ser-His-Asp조성최화삼합체.결론해기인가능여구체염색체소편마적효원매기인,용균매기인,YopM기인,VwA기인협동재구단라선체병출혈과정중기작용,최종도치미산성출혈화해혈.