物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2012年
8期
1837-1842
,共6页
蔡开聪%留珊红%刘的文%林深
蔡開聰%留珊紅%劉的文%林深
채개총%류산홍%류적문%림심
从头算%丙氨酸二肽%振动光谱%酰胺-1带%简正模式分析%势能分布
從頭算%丙氨痠二肽%振動光譜%酰胺-1帶%簡正模式分析%勢能分佈
종두산%병안산이태%진동광보%선알-1대%간정모식분석%세능분포
利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽的二级结构布居特性以及体系势能变化.引入对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带),借助其光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明:丙氨酸二肽分子处于C7(e)q构型(φ/ψ=-80°/80°)时具有最低能量值,且分子易形成β折叠、PP(11)、C5及C7等能量较低的稳定构型.通过简正模式分析,得到分子3N-6个振动模式的吸收光谱,并通过势能分布分析方法对分子骨架上酰胺振动吸收带的特征振动模式进行了指认.重点考察分子骨架上酰胺-1带振动光谱参数与分子构型变化之间的相关性,建立振动光谱参数与蛋白质二级结构之间的联系,为在化学键水平上研究蛋白质的结构及其发挥作用的机制提供科学依据.
利用從頭算方法探索蛋白質模型分子——丙氨痠二肽的二級結構佈居特性以及體繫勢能變化.引入對分子結構敏感的振動探針(酰胺振動吸收帶),藉助其光譜錶象,尋求振動光譜參數與分子結構之間的聯繫.研究結果錶明:丙氨痠二肽分子處于C7(e)q構型(φ/ψ=-80°/80°)時具有最低能量值,且分子易形成β摺疊、PP(11)、C5及C7等能量較低的穩定構型.通過簡正模式分析,得到分子3N-6箇振動模式的吸收光譜,併通過勢能分佈分析方法對分子骨架上酰胺振動吸收帶的特徵振動模式進行瞭指認.重點攷察分子骨架上酰胺-1帶振動光譜參數與分子構型變化之間的相關性,建立振動光譜參數與蛋白質二級結構之間的聯繫,為在化學鍵水平上研究蛋白質的結構及其髮揮作用的機製提供科學依據.
이용종두산방법탐색단백질모형분자——병안산이태적이급결구포거특성이급체계세능변화.인입대분자결구민감적진동탐침(선알진동흡수대),차조기광보표상,심구진동광보삼수여분자결구지간적련계.연구결과표명:병안산이태분자처우C7(e)q구형(φ/ψ=-80°/80°)시구유최저능량치,차분자역형성β절첩、PP(11)、C5급C7등능량교저적은정구형.통과간정모식분석,득도분자3N-6개진동모식적흡수광보,병통과세능분포분석방법대분자골가상선알진동흡수대적특정진동모식진행료지인.중점고찰분자골가상선알-1대진동광보삼수여분자구형변화지간적상관성,건립진동광보삼수여단백질이급결구지간적련계,위재화학건수평상연구단백질적결구급기발휘작용적궤제제공과학의거.
