CAJ | 학술논문

针对具有选择性蛋白质降解功能的泛素在调控昆虫生长发育过程中的重要作用,探讨埃及伊蚊、冈比亚按蚊和致倦库蚊基因组中polyUBQ基因的有关生物信息.采用电子克隆的方法钓取3种蚊虫基因组中polyUBQ基因序列,分析其特征、分子进化关系、遗传多态性和密码子偏爱性.结果显示,成功获取埃及伊蚊、冈比亚按蚊和致倦库蚊polyUBQ基因序列,命名为Aa-polyUBQ(GenBank登录号:AAGE02005963)、Ag-polyUBQ(ABKP02009650)和Cq-polyUBQ(AAWU01023041),分别编码1065个、218个和533个氨基酸残基,各具14个、3个和7个泛素单体,Aa-polyUBQ、Ag-polyUBQ和Cq-polyUBQ蛋白二级结构主要元件是延伸带和无规则卷曲,Leu、Ile和Lys是构成3种蛋白的主要氨基酸,亚细胞主要定位于细胞质和细胞核,无前导肽、信号肽和跨膜结构域,除Ag-polyUBQ蛋白外均呈碱性;3种基因序列的同源性较高(83.8%-88.2%)且遗传距离较近(0.129-0.187);检出135个多态位点,共生成3个单倍型,单倍型多样性(Hd=1.000)、平均核苷酸差异数(K=96.000)、核苷酸多样性(Pi=0.14679)、SS核苷酸多样性均值(Pi(s)=0.57731)、NSS核苷酸多样性均值(Pi(a)=0.01627)、密码子有效值(ENC=29.432-34.321<61)、偏爱指标(CBI=0.672-0.750>0)和X2检验计算(X2=0.977-1.092)显示3种polyUBQ基因间遗传多样性较丰富且呈现较强的密码子偏爱性.Aa-polyUBQ、Ag-polyUBQ和Cq-polyUBQ基因的成功电子克隆及丰富的遗传多态性和较强的密码子偏爱性可为进一步开展其分子进化机制、表达特性和昆虫病毒侵染关系等方面的试验研究提供基础资料.
침대구유선택성단백질강해공능적범소재조공곤충생장발육과정중적중요작용,탐토애급이문、강비아안문화치권고문기인조중polyUBQ기인적유관생물신식.채용전자극륭적방법조취3충문충기인조중polyUBQ기인서렬,분석기특정、분자진화관계、유전다태성화밀마자편애성.결과현시,성공획취애급이문、강비아안문화치권고문polyUBQ기인서렬,명명위Aa-polyUBQ(GenBank등록호:AAGE02005963)、Ag-polyUBQ(ABKP02009650)화Cq-polyUBQ(AAWU01023041),분별편마1065개、218개화533개안기산잔기,각구14개、3개화7개범소단체,Aa-polyUBQ、Ag-polyUBQ화Cq-polyUBQ단백이급결구주요원건시연신대화무규칙권곡,Leu、Ile화Lys시구성3충단백적주요안기산,아세포주요정위우세포질화세포핵,무전도태、신호태화과막결구역,제Ag-polyUBQ단백외균정감성;3충기인서렬적동원성교고(83.8%-88.2%)차유전거리교근(0.129-0.187);검출135개다태위점,공생성3개단배형,단배형다양성(Hd=1.000)、평균핵감산차이수(K=96.000)、핵감산다양성(Pi=0.14679)、SS핵감산다양성균치(Pi(s)=0.57731)、NSS핵감산다양성균치(Pi(a)=0.01627)、밀마자유효치(ENC=29.432-34.321<61)、편애지표(CBI=0.672-0.750>0)화X2검험계산(X2=0.977-1.092)현시3충polyUBQ기인간유전다양성교봉부차정현교강적밀마자편애성.Aa-polyUBQ、Ag-polyUBQ화Cq-polyUBQ기인적성공전자극륭급봉부적유전다태성화교강적밀마자편애성가위진일보개전기분자진화궤제、표체특성화곤충병독침염관계등방면적시험연구제공기출자료.