CAJ | 학술논문

根据白菜花粉特异的多聚半乳糖醛酸酶基因BcMF2的全长序列设计引物,通过PCR直接扩增的方法从'温州盘菜'芜菁(Brassica campestris L. spp. rapifera cv. Wenzhoupancai)中克隆到了BcMF2的同源基因,命名为BcMF2r.经与白菜BcMF2基因序列比较,DNA全长序列相似性高达90%.Blast搜索结果表明,BcMF2r与拟南芥外切多聚半乳糖醛酸酶在氨基酸水平的的相似性为87%,推测BcMF2r属于多聚半乳糖醛酸酶基因.BcMF2r基因最大开放阅读框为1263 bp,编码420个氨基酸序列,编码的蛋白质分子量为43.8 kDa,等电点为8.108;碱性氨基酸(K, R) 36个;酸性氨基酸(D, E) 32个;疏水氨基酸(A, I, L, F, W, V)152个;极性氨基酸(N, C, Q, S, T, Y)113个.推导的氨基酸序列通过Prosite数据库查询,发现该序列包括3个N-糖基化位点,4个蛋白激酶C磷酸化位点,6个酪蛋白激酶II磷酸化位点,12个N-豆蔻酰化位点, 1个多聚半乳糖醛酸酶活性位点(257RVTCGPGHGLSVGS)等.通过PROFsec预测BcMF2r蛋白质的二级结构,表明该蛋白含7.86% helix,46.90% sheet和45.24% loop.将BcMF2r基因氨基酸序列与数据库中的其他植物PG序列进行同源序列比对,构建系统进化树,发现该基因具有所有PG基因特有的4个保守结构域,并且与花粉中特异表达的PG基因聚为一类,进一步证明了该基因可能是与花粉发育相关的多聚半乳糖醛酸酶基因,在花粉萌发和花粉管伸长中起作用.
근거백채화분특이적다취반유당철산매기인BcMF2적전장서렬설계인물,통과PCR직접확증적방법종'온주반채'무정(Brassica campestris L. spp. rapifera cv. Wenzhoupancai)중극륭도료BcMF2적동원기인,명명위BcMF2r.경여백채BcMF2기인서렬비교,DNA전장서렬상사성고체90%.Blast수색결과표명,BcMF2r여의남개외절다취반유당철산매재안기산수평적적상사성위87%,추측BcMF2r속우다취반유당철산매기인.BcMF2r기인최대개방열독광위1263 bp,편마420개안기산서렬,편마적단백질분자량위43.8 kDa,등전점위8.108;감성안기산(K, R) 36개;산성안기산(D, E) 32개;소수안기산(A, I, L, F, W, V)152개;겁성안기산(N, C, Q, S, T, Y)113개.추도적안기산서렬통과Prosite수거고사순,발현해서렬포괄3개N-당기화위점,4개단백격매C린산화위점,6개락단백격매II린산화위점,12개N-두구선화위점, 1개다취반유당철산매활성위점(257RVTCGPGHGLSVGS)등.통과PROFsec예측BcMF2r단백질적이급결구,표명해단백함7.86% helix,46.90% sheet화45.24% loop.장BcMF2r기인안기산서렬여수거고중적기타식물PG서렬진행동원서렬비대,구건계통진화수,발현해기인구유소유PG기인특유적4개보수결구역,병차여화분중특이표체적PG기인취위일류,진일보증명료해기인가능시여화분발육상관적다취반유당철산매기인,재화분맹발화화분관신장중기작용.