南京农业大学学报
南京農業大學學報
남경농업대학학보
JOURNAL OF NANJING AGRICULTURAL UNIVERSITY
2008年
3期
81-86
,共6页
甘薯%简并引物%抗病基因同源序列(RGA)%克隆
甘藷%簡併引物%抗病基因同源序列(RGA)%剋隆
감서%간병인물%항병기인동원서렬(RGA)%극륭
对根据紫花苜蓿(Medicago truncatula)NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化,筛选出6对简并引物,以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增,克隆甘薯抗病基因同源序列(RGA).结果克隆出342个不同的甘薯RGA,这342个甘薯RGA和已知的抗病基因L6、N、RGC1等具有高度同源性(E value<e×10-20).根据抗病基因同源序列的相似性,利用Cluxtalw软件将其分为22个不同的类群.这些甘薯的抗病基因同源序列已提交GenBank(编号:DQ903322至DQ903664).在342个甘薯RGA中,除7个是TIR外,其余属于non-TIR类型.用Blastx和DNAman 软件对342个甘薯RGA进行列队比较,发现有9个含有抗线虫病RGC1序列的RGA,它们与RGC1的同源性为50%～100%.
對根據紫花苜蓿(Medicago truncatula)NBS區域的保守序列等設計的16對簡併引物進行優化,篩選齣6對簡併引物,以甘藷的基因組DNA為模闆進行PCR擴增,剋隆甘藷抗病基因同源序列(RGA).結果剋隆齣342箇不同的甘藷RGA,這342箇甘藷RGA和已知的抗病基因L6、N、RGC1等具有高度同源性(E value<e×10-20).根據抗病基因同源序列的相似性,利用Cluxtalw軟件將其分為22箇不同的類群.這些甘藷的抗病基因同源序列已提交GenBank(編號:DQ903322至DQ903664).在342箇甘藷RGA中,除7箇是TIR外,其餘屬于non-TIR類型.用Blastx和DNAman 軟件對342箇甘藷RGA進行列隊比較,髮現有9箇含有抗線蟲病RGC1序列的RGA,它們與RGC1的同源性為50%～100%.
대근거자화목숙(Medicago truncatula)NBS구역적보수서렬등설계적16대간병인물진행우화,사선출6대간병인물,이감서적기인조DNA위모판진행PCR확증,극륭감서항병기인동원서렬(RGA).결과극륭출342개불동적감서RGA,저342개감서RGA화이지적항병기인L6、N、RGC1등구유고도동원성(E value<e×10-20).근거항병기인동원서렬적상사성,이용Cluxtalw연건장기분위22개불동적류군.저사감서적항병기인동원서렬이제교GenBank(편호:DQ903322지DQ903664).재342개감서RGA중,제7개시TIR외,기여속우non-TIR류형.용Blastx화DNAman 연건대342개감서RGA진행렬대비교,발현유9개함유항선충병RGC1서렬적RGA,타문여RGC1적동원성위50%～100%.
