军事医学科学院院刊
軍事醫學科學院院刊
군사의학과학원원간
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2010年
2期
153-155
,共3页
谭刚%张雨%司炳银%余蓉%祝庆余
譚剛%張雨%司炳銀%餘蓉%祝慶餘
담강%장우%사병은%여용%축경여
基孔肯雅病毒%基因组%逆转录聚合酶链反应%ESCA
基孔肯雅病毒%基因組%逆轉錄聚閤酶鏈反應%ESCA
기공긍아병독%기인조%역전록취합매련반응%ESCA
目的 对保存的基孔肯雅病毒WJ0601株基因组序列进行测定,并阐明该病毒与已报道毒株序列的关系.方法 对基孔肯雅病毒基因组编码区分14段进行RT-PCR扩增,对非编码区采用RACE法进行扩增,将扩增产物直接进行测序,应用DNAStar软件将测序结果拼接得到基因组序列.结果 与结论基孔肯雅病毒WJ0601株基因组核苷酸共11 826 nt,编码3722个氨基酸,其中5′端的2/3基因组编码4种非结构蛋白nsP1、nsP2、nsP3和nsP4;3′端的1/3基因组编码5种结构蛋白C、E3、E2、6K和E1蛋白.结构基因和非结构基因之间有68 nt的连接区为非翻译区.病毒基因组5′端和3′端分别有76 nt、526 nt的非编码区.序列同源性分析结果表明,此株病毒与S27-African株的同源性最高,两者核苷酸序列同源性为99.9%,氨基酸序列同源性为99.8%,同属于(ESCA)基因型.
目的 對保存的基孔肯雅病毒WJ0601株基因組序列進行測定,併闡明該病毒與已報道毒株序列的關繫.方法 對基孔肯雅病毒基因組編碼區分14段進行RT-PCR擴增,對非編碼區採用RACE法進行擴增,將擴增產物直接進行測序,應用DNAStar軟件將測序結果拼接得到基因組序列.結果 與結論基孔肯雅病毒WJ0601株基因組覈苷痠共11 826 nt,編碼3722箇氨基痠,其中5′耑的2/3基因組編碼4種非結構蛋白nsP1、nsP2、nsP3和nsP4;3′耑的1/3基因組編碼5種結構蛋白C、E3、E2、6K和E1蛋白.結構基因和非結構基因之間有68 nt的連接區為非翻譯區.病毒基因組5′耑和3′耑分彆有76 nt、526 nt的非編碼區.序列同源性分析結果錶明,此株病毒與S27-African株的同源性最高,兩者覈苷痠序列同源性為99.9%,氨基痠序列同源性為99.8%,同屬于(ESCA)基因型.
목적 대보존적기공긍아병독WJ0601주기인조서렬진행측정,병천명해병독여이보도독주서렬적관계.방법 대기공긍아병독기인조편마구분14단진행RT-PCR확증,대비편마구채용RACE법진행확증,장확증산물직접진행측서,응용DNAStar연건장측서결과병접득도기인조서렬.결과 여결론기공긍아병독WJ0601주기인조핵감산공11 826 nt,편마3722개안기산,기중5′단적2/3기인조편마4충비결구단백nsP1、nsP2、nsP3화nsP4;3′단적1/3기인조편마5충결구단백C、E3、E2、6K화E1단백.결구기인화비결구기인지간유68 nt적련접구위비번역구.병독기인조5′단화3′단분별유76 nt、526 nt적비편마구.서렬동원성분석결과표명,차주병독여S27-African주적동원성최고,량자핵감산서렬동원성위99.9%,안기산서렬동원성위99.8%,동속우(ESCA)기인형.