CAJ | 학술논문

鼠疫耶尔森菌菌株91001全基因组序列测定及初步分析
서역야이삼균균주91001전기인조서렬측정급초보분석
Detection and analysis of complete genome sequence of Yersinia pestis human-avirulent strain 91001

万方数据

解放军医学杂志解放軍醫學雜誌 해방군의학잡지
MEDICAL JOURNAL OF CHINESE PEOPLE'S LIBERATION ARMY
2004年 3期 192-199 ,共8页

宋亚军%童宗中%王津%郭兆彪%汪莉%韩延平%张建国%裴德翠%周冬生%秦海鸥%庞昕%韩玉军%翟俊辉%李敏%祁芝珍%金丽霞%戴瑞霞%崔百忠%陈峰%李胜霆%叶辰%杜宗敏%王效义%王俊%于军%杨焕明%汪建%黄培堂%杨瑞馥

송아군%동종중%왕진%곽조표%왕리%한연평%장건국%배덕취%주동생%진해구%방흔%한옥군%적준휘%리민%기지진%금려하%대서하%최백충%진봉%리성정%협신%두종민%왕효의%왕준%우군%양환명%왕건%황배당%양서복

耶尔森氏菌,鼠疫%基因组%进化%序列分析,DNA 耶爾森氏菌,鼠疫%基因組%進化%序列分析,DNA
야이삼씨균,서역%기인조%진화%서렬분석,DNA

目的测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株91001的全基因组序列,并通过比较基因组学研究,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线.方法采用全基因组鸟枪法测定91001菌株的全基因组序列,利用比较基因组方法对91001与另外2株鼠疫耶尔森菌(CO92和KIM)的全基因组进行比较研究.结果 91001菌株的基因组包括1条染色体和4个质粒(pPCP1、pCD1、pMT1和pCRY).pPCP1质粒长度为9 609bp,与参考菌株基本一致;pCD1质粒是编码Ⅲ型分泌系统的质粒,长度为70 159bp,编码情况与参考菌株基本相同,但重排导致了质粒的结构与参考菌株存在差异;pMT1质粒长度为106 642bp,保留了较多的原始质粒片段,毒力相关基因与参考菌株没有差异;pCRY质粒是本研究中新发现的质粒,在国内外研究中未曾报道,这一质粒长度为21 742bp,具有独立复制能力,有一群编码Ⅳ型分泌系统的基因.91001菌株的染色体长度为4 595 065bp,有4 037个编码序列(CDS),其中141个是假基因;染色体中存在着非常丰富的插入序列,由于存在IS序列介导的基因组重排,91001菌株染色体的结构与参考菌株存在较大差异.通过比较基因组学分析,初步确定了91001菌株甘油降解阳性、硝酸盐还原阴性、阿拉伯糖分解代谢阴性以及蜜二糖分解阳性的遗传基础.结论根据质粒结构、染色体基因组重排、硝酸盐还原阴性的机制以及假基因的分布等信息,推测以91001菌株为代表的田鼠型菌株是原始鼠疫耶尔森菌进化过程中的另一个分支,与现有菌株存在着比较明显的差异;而91001菌株独特的致病性可能与基因组中的假基因或大片段缺失有关.
목적측정대인불치병적서역야이삼균포씨전서역원지균주91001적전기인조서렬,병통과비교기인조학연구,탐색서역야이삼균치병성적유전학궤제화진화로선.방법채용전기인조조창법측정91001균주적전기인조서렬,이용비교기인조방법대91001여령외2주서역야이삼균(CO92화KIM)적전기인조진행비교연구.결과 91001균주적기인조포괄1조염색체화4개질립(pPCP1、pCD1、pMT1화pCRY).pPCP1질립장도위9 609bp,여삼고균주기본일치;pCD1질립시편마Ⅲ형분비계통적질립,장도위70 159bp,편마정황여삼고균주기본상동,단중배도치료질립적결구여삼고균주존재차이;pMT1질립장도위106 642bp,보류료교다적원시질립편단,독력상관기인여삼고균주몰유차이;pCRY질립시본연구중신발현적질립,재국내외연구중미증보도,저일질립장도위21 742bp,구유독립복제능력,유일군편마Ⅳ형분비계통적기인.91001균주적염색체장도위4 595 065bp,유4 037개편마서렬(CDS),기중141개시가기인;염색체중존재착비상봉부적삽입서렬,유우존재IS서렬개도적기인조중배,91001균주염색체적결구여삼고균주존재교대차이.통과비교기인조학분석,초보학정료91001균주감유강해양성、초산염환원음성、아랍백당분해대사음성이급밀이당분해양성적유전기출.결론근거질립결구、염색체기인조중배、초산염환원음성적궤제이급가기인적분포등신식,추측이91001균주위대표적전서형균주시원시서역야이삼균진화과정중적령일개분지,여현유균주존재착비교명현적차이;이91001균주독특적치병성가능여기인조중적가기인혹대편단결실유관.