CAJ | 학술논문

从NCBI公共数据库中随机下载葡萄表达序列标签(expressed sequence tag,EST)8 925条,利用Phrap软件对这些序列进行拼接后形成5 42条序列,利用MISA软件共发掘出含有SSR位点的序列336条,共含有367个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为6.50%.二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复单元的SSR数目分别为79 (21.53%)、83(22.62%)、29(7.9%)、60( 16.35%)和116(31.61%).利用Primer 3.0 Plus软件随机设计50对引物进行PCR扩增,用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析这些SSR引物的PCR扩增产物多态性.50对引物中有36对引物能在20个葡萄品种中扩增出理想的PCR产物,占总引物的72%.其中,26对引物扩增条带具有多态性.利用16对经过验证的EST-SSR引物对20个葡萄品种亲缘关系的分析获得了理想的研究结果.
종NCBI공공수거고중수궤하재포도표체서렬표첨(expressed sequence tag,EST)8 925조,이용Phrap연건대저사서렬진행병접후형성5 42조서렬,이용MISA연건공발굴출함유SSR위점적서렬336조,공함유367개SSR위점,후선SSR위점출현적빈솔위6.50%.이핵감산、삼핵감산、사핵감산、오핵감산화륙핵감산중복단원적SSR수목분별위79 (21.53%)、83(22.62%)、29(7.9%)、60( 16.35%)화116(31.61%).이용Primer 3.0 Plus연건수궤설계50대인물진행PCR확증,용6%비변성취병희선알응효전영분석저사SSR인물적PCR확증산물다태성.50대인물중유36대인물능재20개포도품충중확증출이상적PCR산물,점총인물적72%.기중,26대인물확증조대구유다태성.이용16대경과험증적EST-SSR인물대20개포도품충친연관계적분석획득료이상적연구결과.