中国海洋大学学报(自然科学版)
中國海洋大學學報(自然科學版)
중국해양대학학보(자연과학판)
PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2011年
9期
48-52
,共5页
侯晓阳%孙铂光%刘吉文%孙婧%张晓华
侯曉暘%孫鉑光%劉吉文%孫婧%張曉華
후효양%손박광%류길문%손청%장효화
哈维氏弧菌%毒性相关质粒%结构解析
哈維氏弧菌%毒性相關質粒%結構解析
합유씨호균%독성상관질립%결구해석
哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)是水产养殖动物的常见致病菌.前期研究发现,哈维氏弧菌致病性最强的菌株VIB645含有2个核苷酸序列非常相似的溶血素基因-vhhA和vhhB,分别位于染色体DNA和1个大小约为65.6 kb的质粒上(命名为pVH1).本研究用碱裂解法提取该菌株的毒性相关质粒pVH1,利用多种限制性内切酶进行酶切,构建随机DNA文库并测序.合计测序97.63 kb,覆盖度为148.3%,鉴定出125个ORF(开放阅读框,>150 bp).这些预测的ORF,根据其功能主要分为以下几类:(1)毒力相关基因,包括RTX毒素钙离子结合蛋白、转铁蛋白结合蛋白A前体、外膜粘附蛋白;(2)结合转运相关基因,包括TraC、-D、-F、-G、-H、-I、-K、-N、-U、-W、TrbB、-C;(3)转座相关基因;(4)其他功能基因,如甲基转移酶,DNA结合蛋白,DNA复制蛋白DnaC等;(5)未知基因.本研究结果对揭示哈维氏弧菌的致病机理具有重要意义.
哈維氏弧菌(Vibrio harveyi)是水產養殖動物的常見緻病菌.前期研究髮現,哈維氏弧菌緻病性最彊的菌株VIB645含有2箇覈苷痠序列非常相似的溶血素基因-vhhA和vhhB,分彆位于染色體DNA和1箇大小約為65.6 kb的質粒上(命名為pVH1).本研究用堿裂解法提取該菌株的毒性相關質粒pVH1,利用多種限製性內切酶進行酶切,構建隨機DNA文庫併測序.閤計測序97.63 kb,覆蓋度為148.3%,鑒定齣125箇ORF(開放閱讀框,>150 bp).這些預測的ORF,根據其功能主要分為以下幾類:(1)毒力相關基因,包括RTX毒素鈣離子結閤蛋白、轉鐵蛋白結閤蛋白A前體、外膜粘附蛋白;(2)結閤轉運相關基因,包括TraC、-D、-F、-G、-H、-I、-K、-N、-U、-W、TrbB、-C;(3)轉座相關基因;(4)其他功能基因,如甲基轉移酶,DNA結閤蛋白,DNA複製蛋白DnaC等;(5)未知基因.本研究結果對揭示哈維氏弧菌的緻病機理具有重要意義.
합유씨호균(Vibrio harveyi)시수산양식동물적상견치병균.전기연구발현,합유씨호균치병성최강적균주VIB645함유2개핵감산서렬비상상사적용혈소기인-vhhA화vhhB,분별위우염색체DNA화1개대소약위65.6 kb적질립상(명명위pVH1).본연구용감렬해법제취해균주적독성상관질립pVH1,이용다충한제성내절매진행매절,구건수궤DNA문고병측서.합계측서97.63 kb,복개도위148.3%,감정출125개ORF(개방열독광,>150 bp).저사예측적ORF,근거기공능주요분위이하궤류:(1)독력상관기인,포괄RTX독소개리자결합단백、전철단백결합단백A전체、외막점부단백;(2)결합전운상관기인,포괄TraC、-D、-F、-G、-H、-I、-K、-N、-U、-W、TrbB、-C;(3)전좌상관기인;(4)기타공능기인,여갑기전이매,DNA결합단백,DNA복제단백DnaC등;(5)미지기인.본연구결과대게시합유씨호균적치병궤리구유중요의의.