生态环境学报
生態環境學報
생태배경학보
ECOLOGY AND ENVIRONMENT
2011年
12期
1898-1901
,共4页
马奔%章群%司从利%黄小彧
馬奔%章群%司從利%黃小彧
마분%장군%사종리%황소욱
赤潮%棕囊藻%质体16S rDNA
赤潮%棕囊藻%質體16S rDNA
적조%종낭조%질체16S rDNA
测定了采自香港2株球形棕囊藻和湛江1株等鞭金藻质体16S rDNA基因序列,结合GenBank中下载的32条同源序列,分析序列特征并构建分子系统树.发现600 bp序列中有可变位点42个,简约信息位点33个,可变位点和简约信息位点分别为全序列的7.0%和5.5%.A+T的含量(52.5%)略大于C+G含量(47.5%),与已报道的棕囊藻属叶绿体和线粒体基因相似;在分子系统树上,同属藻种聚类在一起,属间遗传距离分别为0.025 5~0.050 3.棕囊藻属属内遗传距离0-0.005 0,不同藻种相混杂,并未独立成支;质体16s rDNA部分序列虽不能区分棕囊藻属内不同藻种,但能鉴定出GenBank中27个环境样品为棕囊藻属藻株,从而能确定其地理分布和相对丰度,对棕囊藻赤潮的预测预报具有重要意义.质体16srDNA在其他赤潮藻类物种鉴定方面的应用需要进一步研究.
測定瞭採自香港2株毬形棕囊藻和湛江1株等鞭金藻質體16S rDNA基因序列,結閤GenBank中下載的32條同源序列,分析序列特徵併構建分子繫統樹.髮現600 bp序列中有可變位點42箇,簡約信息位點33箇,可變位點和簡約信息位點分彆為全序列的7.0%和5.5%.A+T的含量(52.5%)略大于C+G含量(47.5%),與已報道的棕囊藻屬葉綠體和線粒體基因相似;在分子繫統樹上,同屬藻種聚類在一起,屬間遺傳距離分彆為0.025 5~0.050 3.棕囊藻屬屬內遺傳距離0-0.005 0,不同藻種相混雜,併未獨立成支;質體16s rDNA部分序列雖不能區分棕囊藻屬內不同藻種,但能鑒定齣GenBank中27箇環境樣品為棕囊藻屬藻株,從而能確定其地理分佈和相對豐度,對棕囊藻赤潮的預測預報具有重要意義.質體16srDNA在其他赤潮藻類物種鑒定方麵的應用需要進一步研究.
측정료채자향항2주구형종낭조화담강1주등편금조질체16S rDNA기인서렬,결합GenBank중하재적32조동원서렬,분석서렬특정병구건분자계통수.발현600 bp서렬중유가변위점42개,간약신식위점33개,가변위점화간약신식위점분별위전서렬적7.0%화5.5%.A+T적함량(52.5%)략대우C+G함량(47.5%),여이보도적종낭조속협록체화선립체기인상사;재분자계통수상,동속조충취류재일기,속간유전거리분별위0.025 5~0.050 3.종낭조속속내유전거리0-0.005 0,불동조충상혼잡,병미독립성지;질체16s rDNA부분서렬수불능구분종낭조속내불동조충,단능감정출GenBank중27개배경양품위종낭조속조주,종이능학정기지리분포화상대봉도,대종낭조적조적예측예보구유중요의의.질체16srDNA재기타적조조류물충감정방면적응용수요진일보연구.