西北农业学报
西北農業學報
서북농업학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-OCCIDENTALIS SINICA
2012年
7期
1-9
,共9页
马向辉%昝林森%杨宁%高建斌%朱光星%成功%王洪宝%郝瑞杰%付常振%姜碧杰%詹小立
馬嚮輝%昝林森%楊寧%高建斌%硃光星%成功%王洪寶%郝瑞傑%付常振%薑碧傑%詹小立
마향휘%잠림삼%양저%고건빈%주광성%성공%왕홍보%학서걸%부상진%강벽걸%첨소립
秦川牛%TNFSF11基因%PCR-CRS%PCR-RFLP%多态性%单倍型
秦川牛%TNFSF11基因%PCR-CRS%PCR-RFLP%多態性%單倍型
진천우%TNFSF11기인%PCR-CRS%PCR-RFLP%다태성%단배형
为研究秦川牛TNFSF11基因多态性及其与秦川牛体尺性状的相关性,以399头同等饲养条件下的18～24月龄健康秦川母牛为研究对象,采用PCR-RFLP技术结合DNA测序技术检测TNFSF11基因的SNPs位点,并将其与秦川牛体尺性状进行关联分析.结果表明,DNA测序发现在TNFSF11基因第3内含子即34 080 bp处(C331区域)和第3内含子34 096 bp处(C332区域)分别发生C→T突变和T→C突变；PCR-RFLP分析发现,秦川牛TNFSF11基因C331区域经创造酶切位点后可以被限制性内切酶HincⅡ特异切割为有GG、GH和HH3种基因型,C332区域可以被内切酶BseLⅠ特异切割为MM、MN和NN 3种基因型；与测序结果比对显示,秦川牛TNFSF11基因C331、C332各酶切基因型与测序结果显示相一致.卡方检验显示,C331位点在所检测牛群中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05),而C332位点则处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P＜0.01)；且C331处GH基因型为优势基因型,G等位基因为优势等位基因,处于中度多态状态；C332处基因型MM为优势基因型,M等位基因为优势基因,处于中度多态状态；关联分析表明,C331位点不同基因型个体间在腰高、腰角宽和胸围方面差异显著(P＜0.05),C332位点在体斜长和腰高方面差异显著(P＜0.05).经连锁不平衡检测发现,两位点存在一定的连锁特性(r2=0.213),将两突变位点进行单倍型分析可知,HHMM基因型各性状均显著高于其他基因型组合,且多标记位点的组合效应值高于单标记位点.说明TNFSF11基因对秦川牛体尺性状有显著的影响,可以作为秦川肉牛新品系培育早期选择的候选基因,其中组合HHMM可能是影响秦川牛体尺胴体性状的最佳基因型组合,在选育中应加大其选择力度.
為研究秦川牛TNFSF11基因多態性及其與秦川牛體呎性狀的相關性,以399頭同等飼養條件下的18～24月齡健康秦川母牛為研究對象,採用PCR-RFLP技術結閤DNA測序技術檢測TNFSF11基因的SNPs位點,併將其與秦川牛體呎性狀進行關聯分析.結果錶明,DNA測序髮現在TNFSF11基因第3內含子即34 080 bp處(C331區域)和第3內含子34 096 bp處(C332區域)分彆髮生C→T突變和T→C突變；PCR-RFLP分析髮現,秦川牛TNFSF11基因C331區域經創造酶切位點後可以被限製性內切酶HincⅡ特異切割為有GG、GH和HH3種基因型,C332區域可以被內切酶BseLⅠ特異切割為MM、MN和NN 3種基因型；與測序結果比對顯示,秦川牛TNFSF11基因C331、C332各酶切基因型與測序結果顯示相一緻.卡方檢驗顯示,C331位點在所檢測牛群中處于Hardy-Weinberg平衡狀態(P＞0.05),而C332位點則處于Hardy-Weinberg極度不平衡狀態(P＜0.01)；且C331處GH基因型為優勢基因型,G等位基因為優勢等位基因,處于中度多態狀態；C332處基因型MM為優勢基因型,M等位基因為優勢基因,處于中度多態狀態；關聯分析錶明,C331位點不同基因型箇體間在腰高、腰角寬和胸圍方麵差異顯著(P＜0.05),C332位點在體斜長和腰高方麵差異顯著(P＜0.05).經連鎖不平衡檢測髮現,兩位點存在一定的連鎖特性(r2=0.213),將兩突變位點進行單倍型分析可知,HHMM基因型各性狀均顯著高于其他基因型組閤,且多標記位點的組閤效應值高于單標記位點.說明TNFSF11基因對秦川牛體呎性狀有顯著的影響,可以作為秦川肉牛新品繫培育早期選擇的候選基因,其中組閤HHMM可能是影響秦川牛體呎胴體性狀的最佳基因型組閤,在選育中應加大其選擇力度.
위연구진천우TNFSF11기인다태성급기여진천우체척성상적상관성,이399두동등사양조건하적18～24월령건강진천모우위연구대상,채용PCR-RFLP기술결합DNA측서기술검측TNFSF11기인적SNPs위점,병장기여진천우체척성상진행관련분석.결과표명,DNA측서발현재TNFSF11기인제3내함자즉34 080 bp처(C331구역)화제3내함자34 096 bp처(C332구역)분별발생C→T돌변화T→C돌변；PCR-RFLP분석발현,진천우TNFSF11기인C331구역경창조매절위점후가이피한제성내절매HincⅡ특이절할위유GG、GH화HH3충기인형,C332구역가이피내절매BseLⅠ특이절할위MM、MN화NN 3충기인형；여측서결과비대현시,진천우TNFSF11기인C331、C332각매절기인형여측서결과현시상일치.잡방검험현시,C331위점재소검측우군중처우Hardy-Weinberg평형상태(P＞0.05),이C332위점칙처우Hardy-Weinberg겁도불평형상태(P＜0.01)；차C331처GH기인형위우세기인형,G등위기인위우세등위기인,처우중도다태상태；C332처기인형MM위우세기인형,M등위기인위우세기인,처우중도다태상태；관련분석표명,C331위점불동기인형개체간재요고、요각관화흉위방면차이현저(P＜0.05),C332위점재체사장화요고방면차이현저(P＜0.05).경련쇄불평형검측발현,량위점존재일정적련쇄특성(r2=0.213),장량돌변위점진행단배형분석가지,HHMM기인형각성상균현저고우기타기인형조합,차다표기위점적조합효응치고우단표기위점.설명TNFSF11기인대진천우체척성상유현저적영향,가이작위진천육우신품계배육조기선택적후선기인,기중조합HHMM가능시영향진천우체척동체성상적최가기인형조합,재선육중응가대기선택력도.
