北京师范大学学报（自然科学版）
北京師範大學學報（自然科學版）
북경사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF BEIJING NORMAL UNIVERSITY
2005年
2期
169-171
,共3页
SARS冠状病毒%系统发育基因组研究%分子标签
SARS冠狀病毒%繫統髮育基因組研究%分子標籤
SARS관상병독%계통발육기인조연구%분자표첨
对SARS冠状病毒(SARS Coronavirus,SARS-CoV)进行了系统发育基因组研究.应用CLUSAL-X1.83程序,将来自GenBank数据库的全部102条SARS-CoV全基因组序列记录做多序列联配,然后采用MEGA3软件包进行系统发育基因组分析,使用邻接法构建系统发育树.根据该系统树,SARS-CoV全基因组记录可以分为2类.第1类包括2个来源于动物的分离株;第2类则覆盖了所有的人源分离株,并且可进一步分为2组,其中第1组包括5个来自于广东省的分离株,而第2组则覆盖了其他的来自于香港、内地和海外的分离株.这一分支格局代表了SARS-CoV从兽到人、从广东到全球的传播过程,并且基因组的替代变异幅度在传播过程中由大到小,逐渐稳定下来.还详细地给出了区分上述2群和2组的分子标签,为新毒株的鉴定和分型提供了理论依据.
對SARS冠狀病毒(SARS Coronavirus,SARS-CoV)進行瞭繫統髮育基因組研究.應用CLUSAL-X1.83程序,將來自GenBank數據庫的全部102條SARS-CoV全基因組序列記錄做多序列聯配,然後採用MEGA3軟件包進行繫統髮育基因組分析,使用鄰接法構建繫統髮育樹.根據該繫統樹,SARS-CoV全基因組記錄可以分為2類.第1類包括2箇來源于動物的分離株;第2類則覆蓋瞭所有的人源分離株,併且可進一步分為2組,其中第1組包括5箇來自于廣東省的分離株,而第2組則覆蓋瞭其他的來自于香港、內地和海外的分離株.這一分支格跼代錶瞭SARS-CoV從獸到人、從廣東到全毬的傳播過程,併且基因組的替代變異幅度在傳播過程中由大到小,逐漸穩定下來.還詳細地給齣瞭區分上述2群和2組的分子標籤,為新毒株的鑒定和分型提供瞭理論依據.
대SARS관상병독(SARS Coronavirus,SARS-CoV)진행료계통발육기인조연구.응용CLUSAL-X1.83정서,장래자GenBank수거고적전부102조SARS-CoV전기인조서렬기록주다서렬련배,연후채용MEGA3연건포진행계통발육기인조분석,사용린접법구건계통발육수.근거해계통수,SARS-CoV전기인조기록가이분위2류.제1류포괄2개래원우동물적분리주;제2류칙복개료소유적인원분리주,병차가진일보분위2조,기중제1조포괄5개래자우광동성적분리주,이제2조칙복개료기타적래자우향항、내지화해외적분리주.저일분지격국대표료SARS-CoV종수도인、종엄동도전구적전파과정,병차기인조적체대변이폭도재전파과정중유대도소,축점은정하래.환상세지급출료구분상술2군화2조적분자표첨,위신독주적감정화분형제공료이론의거.
