海洋学报(中文版)
海洋學報(中文版)
해양학보(중문판)
ACTA OCEANOLOGICA SINICA
2008年
5期
107-112
,共6页
赤潮异弯藻%ITS%分子鉴定
赤潮異彎藻%ITS%分子鑒定
적조이만조%ITS%분자감정
对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区(ITS区)进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息,比较了它们的遗传距离和相似系数,同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息,采用邻接法(neighl)OUr.joining,NJ)和最小进化法(minimum evolution,ME)构建系统发育树.结果表明,五株赤潮异弯藻ITS全序列总长度及碱基组成完全一致,均为538 bp,与GenBank中收录的四株赤潮异弯藻仅有一个碱基不同,遗传距离和相似系数分别为0.002和0.980,而与其他赤潮异弯藻ITS序列完全相同,遗传距离和相似系数分别为0.000和1.000.用两种方法构建的系统发育树结构完全一致,赤潮异弯藻属与海洋卡盾藻属亲缘关系较近,而与另外两属的亲缘关系较远.
對五株赤潮異彎藻覈糖體轉錄單元內間隔區(ITS區)進行瞭PCR擴增和序列測定,併結閤GenBank中收錄的所有赤潮異彎藻ITS序列信息,比較瞭它們的遺傳距離和相似繫數,同時結閤GenBank中髮佈的針胞藻綱其他三箇屬的代錶種ITS序列信息,採用鄰接法(neighl)OUr.joining,NJ)和最小進化法(minimum evolution,ME)構建繫統髮育樹.結果錶明,五株赤潮異彎藻ITS全序列總長度及堿基組成完全一緻,均為538 bp,與GenBank中收錄的四株赤潮異彎藻僅有一箇堿基不同,遺傳距離和相似繫數分彆為0.002和0.980,而與其他赤潮異彎藻ITS序列完全相同,遺傳距離和相似繫數分彆為0.000和1.000.用兩種方法構建的繫統髮育樹結構完全一緻,赤潮異彎藻屬與海洋卡盾藻屬親緣關繫較近,而與另外兩屬的親緣關繫較遠.
대오주적조이만조핵당체전록단원내간격구(ITS구)진행료PCR확증화서렬측정,병결합GenBank중수록적소유적조이만조ITS서렬신식,비교료타문적유전거리화상사계수,동시결합GenBank중발포적침포조강기타삼개속적대표충ITS서렬신식,채용린접법(neighl)OUr.joining,NJ)화최소진화법(minimum evolution,ME)구건계통발육수.결과표명,오주적조이만조ITS전서렬총장도급감기조성완전일치,균위538 bp,여GenBank중수록적사주적조이만조부유일개감기불동,유전거리화상사계수분별위0.002화0.980,이여기타적조이만조ITS서렬완전상동,유전거리화상사계수분별위0.000화1.000.용량충방법구건적계통발육수결구완전일치,적조이만조속여해양잡순조속친연관계교근,이여령외량속적친연관계교원.
