生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
3期
194-197
,共4页
孙汉顺%马文丽%高静宇%孙立哲%郑文岭
孫漢順%馬文麗%高靜宇%孫立哲%鄭文嶺
손한순%마문려%고정우%손립철%정문령
HIV%整合位点%选择机制%聚类分析%特征提取
HIV%整閤位點%選擇機製%聚類分析%特徵提取
HIV%정합위점%선택궤제%취류분석%특정제취
已有研究证明,HIV整合位点的选择, 与宿主基因组功能和染色体结构特性之间存在着紧密的联系,但是具体的选择机制还不明确.使用聚类分析、特征提取、分类分析等生物信息学方法,对HIV整合位点序列进行分析和研究,挖掘HIV整合位点序列之间的关系,探索HIV整合位点的选择规律.通过实验和计算,从HIV整合位点集合中提取出了含有6个特征向量的向量集,该向量集与大部分整合位点的特征向量具有较高的相关性,从而提示了HIV整合位点选择中的规律性,即符合向量集的宿主DNA序列可为HIV的整合位点.研究结果为进一步揭示HIV整合位点的选择机制提供了可供参考的依据.
已有研究證明,HIV整閤位點的選擇, 與宿主基因組功能和染色體結構特性之間存在著緊密的聯繫,但是具體的選擇機製還不明確.使用聚類分析、特徵提取、分類分析等生物信息學方法,對HIV整閤位點序列進行分析和研究,挖掘HIV整閤位點序列之間的關繫,探索HIV整閤位點的選擇規律.通過實驗和計算,從HIV整閤位點集閤中提取齣瞭含有6箇特徵嚮量的嚮量集,該嚮量集與大部分整閤位點的特徵嚮量具有較高的相關性,從而提示瞭HIV整閤位點選擇中的規律性,即符閤嚮量集的宿主DNA序列可為HIV的整閤位點.研究結果為進一步揭示HIV整閤位點的選擇機製提供瞭可供參攷的依據.
이유연구증명,HIV정합위점적선택, 여숙주기인조공능화염색체결구특성지간존재착긴밀적련계,단시구체적선택궤제환불명학.사용취류분석、특정제취、분류분석등생물신식학방법,대HIV정합위점서렬진행분석화연구,알굴HIV정합위점서렬지간적관계,탐색HIV정합위점적선택규률.통과실험화계산,종HIV정합위점집합중제취출료함유6개특정향량적향량집,해향량집여대부분정합위점적특정향량구유교고적상관성,종이제시료HIV정합위점선택중적규률성,즉부합향량집적숙주DNA서렬가위HIV적정합위점.연구결과위진일보게시HIV정합위점적선택궤제제공료가공삼고적의거.
