中华微生物学和免疫学杂志
中華微生物學和免疫學雜誌
중화미생물학화면역학잡지
CHINESE JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
2007年
8期
747-750
,共4页
梁靖瑞%韦献飞%薛城%吉彦莉%马亚琪%唐荣兰%朱永红%庄辉
樑靖瑞%韋獻飛%薛城%吉彥莉%馬亞琪%唐榮蘭%硃永紅%莊輝
량정서%위헌비%설성%길언리%마아기%당영란%주영홍%장휘
戊型肝炎病毒%基因型%亚型%猪
戊型肝炎病毒%基因型%亞型%豬
무형간염병독%기인형%아형%저
目的 调查猪HEV的基因型和亚型.方法 收集新疆南部和广西柳州地区3月龄以下猪粪便标本134份,用巢式逆转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测戊型肝炎病毒核糖核酸(HEVRNA),对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和TreeView软件与目前新的分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析.结果 新疆和广西猪粪便标本的HEV RNA阳性率分别为3.64%(2/55)和3.80%(3/79),命名为XJ3-2、XJ3-6、GX3-1、GX5-2和GX6-3.5株猪HEV的开放阅读框架1(ORF1)的部分核苷酸序列与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为74%～77%、76%～77%、73%～81%和82%～98%.同时对开放阅读框架2(ORF2)部分核苷酸序列进行了分析,GX3-1和GX6-3与Ⅳb亚型相似性最高,为88%～95%.GX5-2、XJ3-2和XJ3-6与Ⅳa亚型相似性最高,为90%～96%.结论 新疆和广西5株猪HEV均属于基因型Ⅳ,新疆2株为Ⅳa亚型,广西1株为Ⅳa,另2株为Ⅳb亚型.未检测到HEV基因Ⅰ型和Ⅲ型.
目的 調查豬HEV的基因型和亞型.方法 收集新疆南部和廣西柳州地區3月齡以下豬糞便標本134份,用巢式逆轉錄聚閤酶鏈反應法(RT-nPCR)檢測戊型肝炎病毒覈糖覈痠(HEVRNA),對RT-nPCR暘性擴增產物進行剋隆測序,用Vector NTI Suite 9.0和TreeView軟件與目前新的分型方法所選參攷序列進行覈苷痠序列相似性比較和生物進化樹分析.結果 新疆和廣西豬糞便標本的HEV RNA暘性率分彆為3.64%(2/55)和3.80%(3/79),命名為XJ3-2、XJ3-6、GX3-1、GX5-2和GX6-3.5株豬HEV的開放閱讀框架1(ORF1)的部分覈苷痠序列與Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分彆為74%～77%、76%～77%、73%～81%和82%～98%.同時對開放閱讀框架2(ORF2)部分覈苷痠序列進行瞭分析,GX3-1和GX6-3與Ⅳb亞型相似性最高,為88%～95%.GX5-2、XJ3-2和XJ3-6與Ⅳa亞型相似性最高,為90%～96%.結論 新疆和廣西5株豬HEV均屬于基因型Ⅳ,新疆2株為Ⅳa亞型,廣西1株為Ⅳa,另2株為Ⅳb亞型.未檢測到HEV基因Ⅰ型和Ⅲ型.
목적 조사저HEV적기인형화아형.방법 수집신강남부화엄서류주지구3월령이하저분편표본134빈,용소식역전록취합매련반응법(RT-nPCR)검측무형간염병독핵당핵산(HEVRNA),대RT-nPCR양성확증산물진행극륭측서,용Vector NTI Suite 9.0화TreeView연건여목전신적분형방법소선삼고서렬진행핵감산서렬상사성비교화생물진화수분석.결과 신강화엄서저분편표본적HEV RNA양성솔분별위3.64%(2/55)화3.80%(3/79),명명위XJ3-2、XJ3-6、GX3-1、GX5-2화GX6-3.5주저HEV적개방열독광가1(ORF1)적부분핵감산서렬여Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ화Ⅳ형HEV적상사성분별위74%～77%、76%～77%、73%～81%화82%～98%.동시대개방열독광가2(ORF2)부분핵감산서렬진행료분석,GX3-1화GX6-3여Ⅳb아형상사성최고,위88%～95%.GX5-2、XJ3-2화XJ3-6여Ⅳa아형상사성최고,위90%～96%.결론 신강화엄서5주저HEV균속우기인형Ⅳ,신강2주위Ⅳa아형,엄서1주위Ⅳa,령2주위Ⅳb아형.미검측도HEV기인Ⅰ형화Ⅲ형.
